உயிரியல் & மருத்துவத்தில் மேம்பட்ட நுட்பங்கள்
திறந்த அணுகல்
ஐ.எஸ்.எஸ்.என்: 2379-1764
ஐ.எஸ்.எஸ்.என்: 2379-1764
எலோடி ரான்ஸ், ஜிங் ஹு, ஜெரோம் இ டேனர் மற்றும் கரோலின் அல்ஃபீரி
இரண்டாம் நிலை மற்றும் மூன்றாம் நிலை கட்டமைப்புகளைத் தீர்க்கும் திறன், ஆர்என்ஏ வைரஸ்களின் மரபணுவிற்குள் அவற்றின் சொந்த நிலையில் உள்ளது, இந்த வைரஸ்களின் நகலெடுக்கும் செயல்முறையை தெளிவுபடுத்துவதில் இன்றியமையாத முதல் படியாகும். ஹெபடைடிஸ் சி வைரஸ் (எச்சிவி) மரபணு ஒற்றை (+) ஆர்என்ஏ இழையால் ஆனது, அதன் பிரதிபலிப்பு முதன்மையாக 3'-மொழிபெயர்க்கப்படாத பகுதியால் (3'UTR) கட்டுப்படுத்தப்படுகிறது. 3'UTR ஆனது ஒரு மரபணு வகை-குறிப்பிட்ட மாறி மண்டலம் (VR), ஒரு பாலி (U/UC) ரிபீட் மற்றும் X-tail எனப்படும் பாதுகாக்கப்பட்ட 98-அடிப்படை வரிசை ஆகியவற்றைக் கொண்டுள்ளது. இன் விட்ரோ உயிர்வேதியியல் பகுப்பாய்வில் இருந்து 3'UTR இன் கட்டமைப்பு மாதிரிகள் முன்மொழியப்பட்டாலும், செல்களுக்குள் இருக்கும் முழு நீள வைரஸ் மரபணுவின் ஒரு பகுதியாக அதன் சொந்த அமைப்பு நிச்சயமற்றது. முழு நீள மரபணுவின் 3'UTR இல் உள்ள நேட்டிவ் டபுள்-ஸ்ட்ராண்ட் (டிஎஸ்) மற்றும் சிங்கிள்-ஸ்ட்ராண்ட் (எஸ்எஸ்) ஆர்என்ஏ கட்டமைப்புகளை வரைபடமாக்குவதற்கான வழிமுறையாக , தளம் இயக்கிய RT-qPCR உடன் இணைந்து சிட்டு கெமிக்கல் டேக்கிங்கைச் செய்தோம். . விஆர்-பாலி (யு/யுசி) ரிப்பீட் சீக்வென்ஸில் ssRNA முதன்மையானது என்று முடிவுகள் குறிப்பிடுகின்றன, அதேசமயம் dsRNA கூறுகள் X-வால் வரை கட்டுப்படுத்தப்படுகின்றன. சிட்டு இரசாயன குறியிடல் 3'UTR க்கு வெளியே அமைந்துள்ள தொடர்களின் ஒரு பகுதியை உள்ளடக்கிய VR-poly (U/ UC) மீண்டும் பகுதியில் அமைந்துள்ள ஒரு தனித்துவமான dsRNA உறுப்பு அடையாளம் காணப்பட்டது. இங்கு விவரிக்கப்பட்டுள்ள முடிவுகள், HCV மரபணுவின் 3'UTR வரிசையில் உள்ள இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்புகளை சிட்டு ஆய்வு மற்றும் கண்டறிதலுக்கான முதல் அறிக்கையாக அமைகின்றன. டி.எஸ்.ஆர்.என்.ஏ மற்றும் எஸ்.எஸ்.ஆர்.என்.ஏ ஆகியவற்றைக் குறிக்கும் உள்செல்லுலார் ஆர்.என்.ஏ மாற்றியமைக்கும் முகவர்களின் பயன்பாடு , பி.சி.ஆருடன் இணைந்து இலக்கு வைக்கப்பட்ட ஆர்.என்.ஏ.வின் சுவடு அளவைப் பெருக்க, சிக்கலான உள்செல்லுலார் ஆர்.என்.ஏக்களுக்குள் பூர்வீக இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்புகளை மேப்பிங் செய்வதில் சாத்தியமான பயன்பாட்டைக் கொண்டுள்ளது.