ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

புரோட்டீன் ஸ்டாண்டர்ட் கலவைகளைப் பயன்படுத்தி மாஸ்-ஸ்பெக்ட்ரோமெட்ரி மூலம் பெப்டைட்களைக் கண்டறிதல் மற்றும் புட்டேட்டிவ் அடையாளம் காண ஒருமித்த முறைகளைப் பயன்படுத்துவதற்கான மேம்படுத்தல்

தமன்னா சுல்தானா, ரிக் ஜோர்டான், ஜேம்ஸ் லியான்ஸ்-வெய்லர்

புரோட்டியோமிக் மாஸ்-ஸ்பெக் ட்ராவிலிருந்து சிக்கலான உயிரியல் மாதிரிகளில் பெப்டைடுகள் மற்றும் புரதங்களை சரியான முறையில் அடையாளம் காண்பது பயோ இன்ஃபர்மேட்டிக்ஸில் ஒரு சவாலான பிரச்சனையாகும். அடையாளம் காணும் வழிமுறைகளின் உணர்திறன் மற்றும் தனித்துவம் அடிப்படை மதிப்பெண் முறைகளைப் பொறுத்தது, சில அதிக உணர்திறன் கொண்டவை, மற்றவை இன்னும் குறிப்பிட்டவை. எஃப் அல்லது உயர்-செயல்திறன், தானியங்கு பெப்டைட் அடையாளம், அல்கோ ரிதம் செயல்திறன் மீதான கட்டுப்பாடு, அதன் உணர்திறன் மற்றும் தனித்தன்மை ஆகியவற்றுக்கு இடையேயான வர்த்தகத்தின் அடிப்படையில் விரும்பத்தக்கது. 'ஒருமித்த முறைகள்' எனப்படும் அல்காரிதம்களின் சேர்க்கைகள், தனிப்பட்ட அல்காரித் எம்எஸ்ஸை விட துல்லியமான முடிவுகளை வழங்குவதாகக் காட்டப்பட்டுள்ளது. எவ்வாறாயினும், அல்காரிதம்களின் பெருக்கம் மற்றும் அவற்றின் மாறுபட்ட உள் அமைப்புகளின் காரணமாக, தனிப்பட்ட மற்றும் எங்களுக்கு ஒருமித்த செயல்பாட்டின் முறையான புரிதல் ஜி. அறியப்பட்ட புரதக் கலவைகளைப் பயன்படுத்தி ஒருமித்த மதிப்பெண்ணுக்கான பல்வேறு அணுகுமுறைகளின் ஆழமான பகுப்பாய்வை நாங்கள் செய்தோம், மேலும் மூன்று வெவ்வேறு தேடல் அல்காரிதம்களின் ஒருமித்த அடிப்படையில் உருவாக்கப்பட்ட 2310 அமைப்புகளின் செயல்திறனை மதிப்பீடு செய்தோம்: Mascot, Sequest மற்றும் X!Tandem. உங்கள் கண்டுபிடிப்புகள், மஸ்காட், சீக்யூஸ்ட் மற்றும் எக்ஸ்! டேன்டெம் ஆகியவற்றின் யூனியன் சிறப்பாக செயல்பட்டது (ஒட்டுமொத்த ஏசி க்யூரசியைக் கருத்தில் கொண்டு), மற்றும் 80-99.9% புரோட்டீன் ப்ரோபாபி லிட்டி மற்றும்/அல்லது குறைந்தபட்சம் 2 பெப்டைடுகள் மற்றும்/அல்லது 0-50% குறைந்தபட்சம் புரத அடையாளத்திற்கான பெப்ட் ஐடி நிகழ்தகவு ஒட்டுமொத்த அடிப்படையில் சோதிக்கப்பட்ட அனைத்து ஒருமித்த முறைகளிலும் சிறப்பாக (சராசரியாக) செயல்படுகிறது துல்லியம். உணர்திறன் மற்றும் தனித்தன்மையின் மீது நேரடியான கட்டுப்பாட்டை வழங்குவதற்கான முறை தேர்வு உத்திகளையும் முடிவுகள் பரிந்துரைக்கின்றன.