ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

வைட்டமின் பி6 மற்றும் வைட்டமின் சி வழியாக அஸ்பாரகின் மற்றும் லைசின் எச்சங்களை வேதியியல் மாற்றியமைப்பதன் மூலம் கோவிட்-19 ஸ்பைக் கிளைகோபுரோட்டீனை செயலிழக்கச் செய்வதற்கான உயிர் தகவலியல் அணுகுமுறை

ஹோமா தோராபிசாதே*

மனித செல்களை ஆக்கிரமிக்க, கோவிட்-19 அதன் ஸ்பைக் கிளைகோபுரோட்டீனை முக்கிய மேற்பரப்பு புரதமாக பயன்படுத்துகிறது. வைட்டமின் பி6 (பைரிடாக்சல்-5'-பாஸ்பேட், பிஎல்பி) மற்றும் வைட்டமின் சி (அஸ்கார்பிக் அமிலம்) மூலம் மேற்பரப்பு அணுகக்கூடிய அஸ்பாரகின் மற்றும் லைசின் எச்சங்களின் வேதியியல் மாற்றத்தின் மூலம் இந்த கிளைகோபுரோட்டீனை செயலிழக்கச் செய்யலாம். இந்த மீளக்கூடிய வினையானது ஒரு ஷிஃப் பேஸ் (ஆல்டிமைன்) உருவாவதற்கு வழிவகுக்கிறது, மேலும் அஸ்கார்பேட்டால் குறைக்கப்பட்டதன் விளைவாக நிலையான பாஸ்போபைரிடாக்சில்-லைசில் அல்லது அஸ்பாரகில் கோவலன்ட் பிணைப்புகள் உருவாகின்றன. இந்த நோக்கத்திற்காக, முதலில், 100% அடையாளத்துடன் ஒத்த புரதங்களில் உள்ள ஸ்பைக் கிளைகோபுரோட்டீன் வரிசைகள் ExPASy சேவையகத்தில் உள்ள UniProtKB ஐப் பயன்படுத்தி குறிப்பிடப்பட்டது. இந்த புரதங்கள் அனைத்தும் முறையே 1,255 நீளம் மற்றும் 139,125 நிறை (டா) உள்ளது. பின்னர், பிடிபி இணையதளத்தில் ஒதுக்கப்பட்ட பிடிபி கோப்புகளைப் பயன்படுத்துவதன் மூலம் ஒவ்வொரு வரிசையின் அணுகக்கூடிய பரப்பளவைக் கண்டறிய GetArea மென்பொருள் பயன்படுத்தப்பட்டது. 81 இல் 51 (அஸ்பாரகினுக்கு) மற்றும் 48 இல் 22 (லைசினுக்கு) PLP எதிர்வினைக்கு அணுகக்கூடியது என்று முடிவுகள் வெளிப்படுத்தின. இவ்வாறு, அஸ்பாரகின் மற்றும் லைசின் முனைய அமினோ குழுக்கள் (NH ₂ ) PLP உடன் வினைபுரிந்து ஷிஃப் பேஸ் பிணைப்பை உருவாக்கி பின்னர் அஸ்கார்பிக் அமிலம் குறைப்பதன் மூலம் வலுவான கோவலன்ட் பிணைப்பாக மாற்ற முடியும். இந்த வழியில், இணைப்பு மற்றும் இணைவு செயல்முறை தடுக்கப்படும். இது தடுப்பூசி மற்றும் மருந்து தயாரிப்பதற்கான ஒரு வழியாக இருக்கலாம்.