டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக்ஸ்: திறந்த அணுகல்
திறந்த அணுகல்
ஐ.எஸ்.எஸ்.என்: 2329-8936
ஐ.எஸ்.எஸ்.என்: 2329-8936
டி வாஸ்கோன்செலோஸ்
லென்டிவைரல் டிரான்ஸ்டக்ஷனைத் தொடர்ந்து ப்யூரோமைசின் நிர்ணயம் செய்வது , மனித ஹெமாட்டோபாய்டிக் ஸ்டெம் மற்றும் மூதாதையர் செல்கள் உள்ளிட்ட உயிரணு வகைகளின் வகைப்படுத்தலைப் பயன்படுத்தி தரமான பரிமாற்றம் மற்றும் உச்சரிப்பு சோதனைகளுக்கு மிகவும் உணரப்பட்ட முறையாகும்
. அதன் பரந்த பயன்பாட்டைப் பொருட்படுத்தாமல்,
பாலூட்டிகளின் உயிரணு சமூகங்களில் பாக்டீரியல் ப்யூரோமைசின் என்-அசிடைல்ட்ரான்ஸ்ஃபெரேஸ் (பேக்) தரமான உச்சரிப்பின் சாத்தியமான தாக்கங்கள் தொடர்பான ஆராய்ச்சி போதுமானதாக இல்லை. டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் சுயவிவரங்களை பாதிக்கும் ப்யூரோமைசின் தீர்மானத்திற்கான சாத்தியம் மனித எரித்ரோபொய்சிஸுக்கு
மிகவும் படிக்கப்பட்ட மாதிரியைப் பயன்படுத்தி பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டது
. ஆறு வளர்ந்த ஒலி மனித
பங்களிப்பாளர்களிடமிருந்து அத்தியாவசிய CD34(+) செல்களைப் பயன்படுத்தி பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டது, பண ரீதியாக அணுகக்கூடிய இரண்டு பேக்-என்கோடிங் லென்டிவைரல் வெக்டர்கள் மூலம் கடத்தப்பட்டது மற்றும் கடத்தப்படாத கட்டுப்பாட்டு செல்களுடன் வேறுபடுகிறது
. RNA-Seq தரமான உச்சரிப்பு சுயவிவரங்கள் பிரித்தலின் ப்ரோரித்ரோபிளாஸ்ட் கட்டத்தில் உருவாக்கப்பட்டன
, அந்த நேரத்தில் R-ஸ்டுடியோ நிரலாக்கத்தில் DEseq2 உடன் வேறுபட்ட தரமான உச்சரிப்பு ஆய்வு செய்யப்பட்டது. பல்வேறு லென்டிவைரல் வெக்டார்களின் கடத்துதலுக்குப் பிறகு
, தரமான உச்சரிப்பு சுயவிவரங்கள் மற்றும் ப்யூரோமைசின் இடையே உள்ள வகைகளுக்கு இடையே உள்ள பலன்கள் 0.1% க்கும் குறைவான
ஆர்என்ஏ அடையாள அளவுகளில் பெரும் முரண்பாடுகளால் காட்டப்பட்டது .
ஆயினும்கூட, பேக் தரம் கடத்துதலுக்குப் பிறகு ப்யூரோமைசின் தேர்வு,
கடத்தப்படாத கட்டுப்பாடுகளுடன் முரண்படும்போது முடிக்கப்பட்ட 5% mRNA இல் முக்கியமான மாற்றங்களை ஏற்படுத்தியது.
ஆர்.என்.ஏ-செக் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் சுயவிவரங்களின் மொழிபெயர்ப்பைக் குழப்புவதற்கு ப்யூரோமைசின் தீர்மானத்தின் திறனுக்காக சிந்திக்கப்பட வேண்டும் என்று முடிவுகள் முன்மொழிகின்றன .