என்சைம் பொறியியல்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

சாக்கரோமைசஸ் செரிவிசியா புரோட்டீன்களின் சுத்திகரிப்பு வெற்றி விகிதத்தில் மாடலிங் பகுப்பாய்வு

குவாங் வூ மற்றும் ஷோமின் யான்  

Saccharomyces cerevisiae என்பது ஆராய்ச்சி மற்றும் தொழில்களில் மிகவும் பரவலாகப் பயன்படுத்தப்படும் ஈஸ்ட் ஆகும், இருப்பினும் அதன் புரத உற்பத்திக்கான கீழ்நிலை செயல்முறைகள் விலை அதிகம். இந்த ஆய்வு அமினோ அமில அம்சங்களுடன் புரதச் சுத்திகரிப்பு வெற்றி விகிதத்தைக் கணிக்க எளிய வழியைக் கண்டறிய முயற்சித்தது. லாஜிஸ்டிக் பின்னடைவு மற்றும் நரம்பியல் நெட்வொர்க் மாதிரி 535 அமினோ அமில அம்சங்களை ஒவ்வொன்றாகச் சோதிக்கப் பயன்படுத்தப்பட்டது. S. செரிவிசியாவிலிருந்து வெளிப்படுத்தப்பட்ட 1294 புரதங்களின் சுத்திகரிப்பு நிலைக்கு எதிராக, அவற்றில் 870 சுத்திகரிக்கப்பட்டன. நியூரல் நெட்வொர்க்கின் முன்கணிப்பு செயல்திறன் லாஜிஸ்டிக் பின்னடைவை விட சக்திவாய்ந்ததாக இருப்பதாக முடிவுகள் காட்டுகின்றன. சில அமினோ அமில அம்சங்கள் புரதங்களின் சுத்திகரிப்பு போக்கைக் கணிக்க பயனுள்ளதாக இருக்கும், மேலும் மாறுபட்ட அமினோ அமில அம்சங்கள் குறைந்த குறிப்பிட்ட தன்மையுடன் கூடிய மிக அதிக உணர்திறன் மூலம் சிறப்பாக செயல்படுகின்றன. மேலும், அமினோ அமில ஜோடிகளின் அதிக யூகிக்கக்கூடிய பகுதியைக் கொண்ட S. செரிவிசியா புரதங்கள் குறைவான கணிக்கக்கூடிய பகுதியைக் காட்டிலும் அதிக சுத்திகரிப்பு கணிப்பைக் கொண்டுள்ளன. எனவே, புரோட்டீன் வரிசைத் தகவலின் அடிப்படையில் நரம்பியல் நெட்வொர்க்கைப் பயன்படுத்தி எஸ். இந்த எளிய முன்கணிப்பு செயல்முறையானது ஒரு புரதம் சுத்திகரிக்கப்படுவதற்கான நிகழ்தகவு பற்றிய கருத்தை வழங்க முடியும், இது கண்மூடித்தனமான சோதனைகளை சமாளிக்கவும் வடிவமைக்கப்பட்ட புரதங்களின் உற்பத்தியை அதிகரிக்கவும் உதவியாக இருக்கும்.