டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக்ஸ்: திறந்த அணுகல்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

நாவல் மைக்ரோஆர்என்ஏக்களின் அடையாளம் மற்றும் ஸ்டீவியா ரெபாடியானாவில் அவற்றின் இலக்கு கணிப்பு

விபா மந்தன் மற்றும் காஷ்மீர் சிங்

Stevia rebaudiana Bertoni, அதன் ஊட்டச்சத்து முக்கியத்துவம் மற்றும் அதன் வளர்ந்து வரும் இயற்கை இனிப்பான பயன்பாடு காரணமாக, உலகம் முழுவதும் கவனத்தை ஈர்த்து வருகிறது. இந்த ஆலையின் மரபணு ஒழுங்குமுறை வலையமைப்பை நன்கு புரிந்துகொள்ள, நாவல் மைக்ரோஆர்என்ஏக்களை (மைஆர்என்ஏக்கள்) கண்டறிய உயர்-செயல்திறன் சிறிய ஆர்என்ஏக்களை வரிசைப்படுத்தியுள்ளோம். மைஆர்என்ஏக்கள் என்பது 18-22 நியூக்ளியோடைட்கள் நீளம் கொண்ட குறுகிய எண்டோஜெனஸ் அல்லாத குறியீட்டு சிறிய ஆர்என்ஏ மூலக்கூறுகளின் ஒரு வகுப்பாகும், இதன் முக்கிய செயல்பாடு மரபணு வெளிப்பாட்டைக் கட்டுப்படுத்துவது மொழிபெயர்ப்பு ஒடுக்குமுறை, எம்ஆர்என்ஏ பிளவு மற்றும் எபிஜெனெடிக் மாற்றம் போன்ற பல்வேறு வழிகளில் உள்ளது. நாங்கள் S. rebaudiana sRNA நூலகத்தை உருவாக்கினோம், அதை இலுமினா மரபணு பகுப்பாய்வி II ஐப் பயன்படுத்தி வரிசைப்படுத்திய பிறகு, 2,509,190 தனித்துவமான காட்சிகளைக் குறிக்கும் மொத்தம் 30,472,534 ரீட்கள் பெறப்பட்டன. இந்த வாசிப்புகளிலிருந்து, பன்னிரண்டு 12 நாவல் மைஆர்என்ஏக்கள் கணிக்கப்பட்டன, அவற்றின் முன்னோடிகள் ஸ்டீவியா EST மற்றும் நியூக்ளியோடைடு வரிசைகளிலிருந்து உருவாக்கப்படலாம். அனைத்து நாவல் தொடர்களும் ஸ்டீவியா அல்லது பிற தாவர இனங்களில் முன்னர் விவரிக்கப்படவில்லை. பெரும்பாலான நாவல் மைஆர்என்ஏக்களுக்கு தூண்டுதல் இலக்கு மரபணுக்கள் கணிக்கப்பட்டன, இதில் முக்கியமாக எம்ஆர்என்ஏ குறியாக்க என்சைம்கள் அத்தியாவசிய தாவர வளர்சிதை மாற்றம் மற்றும் சமிக்ஞை பாதைகளை ஒழுங்குபடுத்துகின்றன. எங்கள் முடிவு ஸ்டீவியாவில் உள்ள மைஆர்என்ஏக்களின் எண்ணிக்கையை அதிகரித்துள்ளது, இது ஸ்டீவியா மற்றும் பிற தாவர இனங்களில் உள்ள மைஆர்என்ஏக்களின் உயிரியல் செயல்பாடுகள் மற்றும் பரிணாம வளர்ச்சி பற்றிய கூடுதல் விசாரணைக்கு பயனுள்ளதாக இருக்கும்.