லுகேமியா ஜர்னல்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

டைஹைட்ரோஃபோலேடெரிடக்டேஸ் வகைகளின் மரபணு வகை விநியோகம் மற்றும் இந்திய மக்கள்தொகையில் கடுமையான லிம்போபிளாஸ்டிக் லுகேமியா நோய் பாதிப்புகளில் அவற்றின் பங்கு: ஒரு பரிசோதனை மற்றும் கணக்கீட்டு பகுப்பாய்வு

சுனிதா கொடிடேலா, சுரேஷ் சந்திர பிரதான், ஜெயராமன் முத்துக்குமரன், பிஸ்வஜித் துபாஷி, தெரசா சாண்டோஸ்-சில்வா மற்றும் தேப்தத்தா பாசு

குறிக்கோள்கள்: இந்திய மக்கள்தொகையில் டைஹைட்ரோஃபோலேட் ரிடக்டேஸ் (DHFR) -317A>G மற்றும் -680C>A மாறுபாடுகளின் அலீல் மற்றும் மரபணு வகை அதிர்வெண்களை நிறுவ, கடுமையான லிம்போபிளாஸ்டிக் லுகேமியா (ALL) அபாயத்துடன் இந்த வகைகளின் தொடர்பைக் கண்டறியவும் மற்றும் பகுப்பாய்வு செய்யவும் ஒத்த அல்லாத SNP களின் விளைவுகள் (nsSNPs) மற்றும் 3'மொழிபெயர்க்கப்படாத பகுதி (3'UTR)சிலிகோ கருவிகளைப் பயன்படுத்தி அதன் கட்டமைப்பு மற்றும் செயல்பாட்டில் DHFR மரபணுவின் மாறுபாடுகள்.
முறைகள்: மொத்தம் 235 தொடர்பில்லாத ஆரோக்கியமான தன்னார்வலர்கள் (கட்டுப்பாடுகள்) மற்றும் 127 அனைத்து நோயாளிகளும் (வழக்குகள்) ஆய்வுக்காக நியமிக்கப்பட்டனர். டிஎன்ஏ புற லிகோசைட்டுகளில் இருந்து பிரித்தெடுக்கப்பட்டது. DHFR பாலிமார்பிஸங்களின் மரபணு வகைப்படுத்தல் நிகழ்நேர PCR மூலம் செய்யப்பட்டது. டிஹெச்எஃப்ஆர் மரபணுவின் 3'UTR இல் உள்ள nsSNPகள் மற்றும் மாறுபாடுகளின் தீங்கு விளைவிக்கும் விளைவுகளை கணக்கீட்டு தளங்கள் மூலம் ஆராய்ந்தோம்.
முடிவுகள்: தற்போதைய ஆய்வில், DHFR -317G மற்றும் -680 A அல்லீல்களின் அதிர்வெண் முறையே 33.3% மற்றும் 59.8% என கண்டறியப்பட்டது. ஆய்வு செய்யப்பட்ட DHFR வகைகள் (rs408626 மற்றும் rs442767) அனைவருக்கும் குறிப்பிடத்தக்க ஆபத்தை அளிக்கவில்லை. இன்சிலிகோ பகுப்பாய்வு மூன்று nsSNP கள் DHFR புரதத்தின் கட்டமைப்பு, செயல்பாடு மற்றும் செயல்பாட்டை பாதிக்கும் என்பதை வெளிப்படுத்தியது. 3'UTR SNPகள் காரணமாக நான்கு மைக்ரோஆர்என்ஏ பிணைப்பு தளங்கள் மிகவும் பாதிக்கப்பட்டுள்ளதாக கண்டறியப்பட்டது. மேலும், டாக்கிங் சிமுலேஷன் டிஹெச்எஃப்ஆரின் பூர்வீகம் மற்றும் மூன்று பிறழ்ந்த வடிவங்களுடன் மெத்தோட்ரெக்ஸேட்டின் பிணைப்பு வரிசை D153V (rs121913223)>நேட்டிவ்>G18R (rs61736208)>D187Y (rs205090) என்று பரிந்துரைத்தது.
முடிவு: இந்திய மக்கள்தொகையில் DHFR மாறுபாடுகளின் நெறிமுறை மரபணு வகைப் பரவலைப் புகாரளிக்கும் முதல் ஆய்வு இதுவாகும், மேலும் DHFR (-317A>G மற்றும் -680C>A) மாறுபாடுகள் எல்லாவற்றின் வளர்ச்சிக்கும் சாத்தியமான ஆபத்தை அளிக்காது. DHFR மாறுபாடு மரபணு வகைகளின் விநியோகத்தில் இனங்களுக்கு இடையேயான வேறுபாடுகள் உள்ளன, மேலும் இது DHFR அடி மூலக்கூறுகளுக்கான சிகிச்சை பதிலில் மாறுபாட்டிற்கு வழிவகுக்கும். புரோட்டீன் வரிசை பகுப்பாய்வு rs200904105 DHFR இன் பாஸ்போரிலேஷன் செயல்முறையை (மொழிபெயர்ப்புக்கு பிந்தைய மாற்றம்) பாதிக்கிறது மற்றும் நறுக்குதல் உருவகப்படுத்துதல் rs121913223 பிறழ்ந்த வடிவத்துடன் மெத்தோட்ரெக்ஸேட்டை அதிக தொடர்பு கொள்ள பரிந்துரைத்தது. எனவே, இந்திய மக்கள்தொகையில் இந்த மாறுபாடுகளின் மருத்துவ தாக்கத்தை ஆராய ஆய்வுகள் தேவை.