டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக்ஸ்: திறந்த அணுகல்
திறந்த அணுகல்
ஐ.எஸ்.எஸ்.என்: 2329-8936
ஐ.எஸ்.எஸ்.என்: 2329-8936
அச்சிலோனு சி கான்ராட் மற்றும் மலேகா எஃப் மத்தபாதா
சால்கோன் சின்தேஸ் (CHS) மற்றும் அந்தோசயனிடின் சின்தேஸ் (ANS) ஆகியவை தாவரங்களில் அந்தோசயினின்கள் உற்பத்திக்கு காரணமான முக்கிய நொதிகளில் ஒன்றாகும். அவை பொதுவாக பல மரபணு குடும்பங்களால் குறியாக்கம் செய்யப்படுகின்றன, இந்த குடும்பங்களின் சில உறுப்பினர்கள் வண்ண நிறமிக்கு பங்களிக்கின்றனர். Clivia miniata இல் CHS மற்றும் ANS மரபணுக்களை ஆய்வு ஆய்வு செய்தது; யாருடைய பூக்கும் திசுக்கள் நிற மாற்றங்களுக்கு உட்படுகின்றன. RNA முதல் cDNA வரையிலான மலர் திசுக்களில் இருந்து தனிமைப்படுத்தப்பட்டது மற்றும் மூன்று யூனிஜீன்(கள்) (CmiCHS 11996, CmiCHS 43839 மற்றும் CmiANS) குறுகிய வரிசை நீளம் ஆரம்பத்தில் அடுத்த தலைமுறை வரிசைமுறை நுட்பத்தைப் பயன்படுத்தி பெறப்பட்டது. மரபணு-குறிப்பிட்ட ப்ரைமர்கள் CHS மற்றும் ANS இன் வெளியிடப்படாத ஆரம்ப குறுகிய வரிசைகளிலிருந்து வடிவமைக்கப்பட்டன. PCR க்குப் பிறகு பெருக்கப்பட்ட cDNA நீளம் CmiCHS 11996 (933 bp), CmiCHS 43839 (951 bp) மற்றும் CmiANS (983 bp) ஆகும். தொடக்கமானது CHS மரபணுக்களுக்கான 390 அமினோ அமிலம் கழிக்கப்பட்ட புரதத்தின் (AEN04070) கணிக்கப்பட்ட புரதத்துடன் தொடர்புடைய ORF சட்டத்தை மொழிபெயர்த்தது, மேலும் ANS மரபணு (AGD99672) தொடர்பாக 355 அமினோ அமிலங்களைக் கணித்துள்ளது. சிலிகோ பகுப்பாய்வில் கணக்கிடப்பட்ட மூலக்கூறு எடை மற்றும் கோட்பாட்டு ஐசோ எலக்ட்ரிக் புள்ளி (pI) CmiCHS 11996 மற்றும் CmiCHS43839 ஆகியவை முறையே 31.0 kDa - 6.95 மற்றும் 34.6 kDa - 7.54. தயாரிப்பு பிணைப்பு தளம் மற்றும் செயலில் உள்ள தளத்தின் முக்கியமான மையக்கருத்துகள் கண்டறியப்பட்ட அமினோ அமில வரிசைகளிலிருந்து வெற்றிகரமாக அடையாளம் காணப்பட்டன. பல வரிசை சீரமைப்பு CmiCHS மற்றும் CmiANS வரிசைகள் மிகவும் பாதுகாக்கப்பட்டு, மற்ற தாவரங்களின் சால்கோன் சின்தேஸ்களுடன் உயர் வரிசை அடையாளத்தை (> 83%) பகிர்ந்து கொண்டது என்பதைக் காட்டுகிறது. இருப்பினும், நிகழ்நேர அளவு PCR ஐப் பயன்படுத்தி வெவ்வேறு திசுக்களில் உள்ள இந்த மரபணுக்களின் வெளிப்பாடு சுயவிவரங்களைத் தீர்மானிக்க மற்றொரு மதிப்பீடு செய்யப்பட்டது. CmiCHS மற்றும் CmiANS இன் வெளிப்பாடு நிலைகள் மற்ற திசுக்களுடன் (இலைகள், பாணி மற்றும் களங்கம் மற்றும் ஸ்கேப்) ஒப்பிடும்போது டெப்பல்களில் அதிகமாக இருந்தன. திசுக்களில் உள்ள மரபணுக்களின் இந்த வெளிப்பாடு வடிவங்கள், ஆரஞ்சு மற்றும் மஞ்சள் நிற நிறமிகள் நிச்சயமாக சால்கோன் சின்தேஸ் மற்றும் அந்தோசயனின் சின்தேஸ் ஆகியவற்றின் ஒழுங்குமுறையுடன் தொடர்புடையதாக இருக்கும் என்று பரிந்துரைக்கிறது.