ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

புரோட்டியோமிக்ஸில் ஜிப்ஃப் விதி

Stanislav Naryzhny, Maria Maynskova, Victor Zgoda மற்றும் ?lexander Archakov

மனித உயிரணுக்களில் பல ஆயிரக்கணக்கான புரதக் கூறுகள், புரத இனங்கள்/புரோட்டியோஃபார்ம்கள் உள்ளன, அவற்றின் ஒத்துழைப்பு செல்லுலார் புரோட்டியோமின் சிக்கலான செயல்பாட்டு வழிமுறைகளை வழங்குகிறது. சமீபத்திய முறைகள் இன்னும் இந்த ஒத்துழைப்பின் முழுப் படத்தையும் பெற அனுமதிக்கவில்லை என்றாலும், அவை குறைந்தபட்சம் புரோட்டீம் அளவு மற்றும் புரோட்டீமுக்குள் உள்ள புரத இனங்களின் அளவு விநியோகத்தின் பிரதிநிதித்துவத்தை உருவாக்க ஒரு வாய்ப்பை வழங்குகின்றன. 2DE பகுப்பாய்வைத் தொடர்ந்து புரதக் கறை மற்றும் ESI LC-MS/MS பகுப்பாய்வு இரண்டையும் பயன்படுத்தி, மனித உயிரணுக்களில் உள்ள பல்வேறு புரத இனங்களின் அளவு விநியோகம் பற்றிய பகுப்பாய்வு செய்தோம். திசு மாதிரிகளிலிருந்து முதன்மை கல்லீரல் செல்களுடன் பல மனித புற்றுநோய் செல் கோடுகளை (HepG2, glioblastoma, MCF7) நாங்கள் பகுப்பாய்வு செய்துள்ளோம், மேலும் அவற்றின் மிகுதியில் உள்ள புரத இனங்களின் எண்ணிக்கையின் சார்பு Zipf இன் சட்டத்தால் விவரிக்கப்பட்டுள்ளது என்பதைக் கண்டறிந்தோம்: y=ax-1 ( 1) y என்பது புரத இனங்களின் (N) எண்ணிக்கையைக் குறிக்கும் இடத்தில், x என்பது மிகுதியைக் குறிக்கிறது. மிகுதியானது %V, மற்றும் a=14 என வெளிப்படுத்தப்பட்டால், இறுதி சமன்பாடு: N=14/%V (2) இந்த வகை விநியோகமானது மனித செல்லுலார் புரோட்டியோமின் அடிப்படை செயல்பாட்டு அமைப்பைப் பிரதிபலிக்கும் வாய்ப்பு அதிகம். பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்ட அனைத்து வகையான செல்களிலும் இது ஒரே மாதிரியாக இருப்பதால்.