ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

அழற்சி குடல் நோயின் மரபணு வெளிப்பாடு தரவுத்தொகுப்புகளில் பயோமார்க்ஸர்களின் சரிபார்ப்பு: IL13RA2, PTGS2 மற்றும் WNT5A இன்ஃப்ளிக்சிமாப் சிகிச்சைக்கு பதிலளிக்கக்கூடிய முன்கணிப்பாளர்களாக

András Gyorffy, Máté Kormos, Luca Bartha, András Szabó, Balázs Gyorffy, Jan Budczies மற்றும் Barna Vásárhelyi

பின்னணி: அழற்சி குடல் நோய் (IBD) உள்ள சில நோயாளிகள் infliximab (IFX) சிகிச்சைக்கு பதிலளிப்பதில்லை. மரபணு வெளிப்பாடு ஆய்வுகள், பதிலளிக்காத IBD நோயாளிகளைக் கணிக்க உதவும் மரபணுக்களை வெளிப்படுத்தின. வெளியிடப்பட்ட மரபணுக்களின் பாரபட்சமான சக்தியை சரிபார்ப்பதே எங்கள் நோக்கம்.

முறைகள்: ஐபிடி நோயாளிகளின் மைக்ரோஅரே தரவுத்தொகுப்புகள் ஜியோ தரவுத்தளத்திலிருந்து ('டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக் ஆர்ம்') பதிலளிக்கும் அல்லது IFX க்கு பதிலளிக்கவில்லை. பதிலளிக்கும் மற்றும் பதிலளிக்காத நோயாளிகளை பாகுபடுத்தும் வெளியிடப்பட்ட மரபணுக்கள் பப்மெட் ('பயோமார்க்கர் ஆர்ம்') இல் அடையாளம் காணப்பட்டன. ROC-பகுப்பாய்வைப் பயன்படுத்தி, 'பயோமார்க்கர் ஆர்ம்' இல் உள்ள மரபணுக்களின் பாரபட்சமான செயல்திறன் 'டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக் ஆர்ம்' இன் ஒவ்வொரு தரவுத்தொகுப்பிலும் மீண்டும் சோதிக்கப்பட்டது. நாவல் பாரபட்சமான மரபணுக்களை அடையாளம் காண பெருங்குடல் பயாப்ஸி தரவுத்தொகுப்புகளின் சுயாதீனமான பகுப்பாய்வையும் நாங்கள் செய்தோம்.

முடிவுகள்: நான்கு ஜியோ தரவுத்தொகுப்புகளின் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக் பிரிவில் (முறையே பெருங்குடல் பயாப்ஸிகள் மற்றும் இரத்த அணுக்களிலிருந்து 3 மற்றும் 1) 99 நோயாளிகள் இருந்தனர் (அவர்களில் 59 மற்றும் 40 பேர் முறையே IFX பதிலளிப்பவர்கள் மற்றும் பதிலளிக்காதவர்கள்). பயாப்ஸி மாதிரிகளில் பதிவாகியுள்ள 65 வேட்பாளர் மரபணுக்களில் 25 மரபணுக்கள் குறிப்பிடத்தக்க அளவில் பாகுபாடு காட்டுகின்றன (p <0.05) infliximab பதிலளிப்பவர்கள் மற்றும் மூன்று பயாப்ஸி தரவுத்தொகுப்புகளில் பதிலளிக்காதவர்கள். புற இரத்தத்தில் பதிவாகியுள்ள 39 வேட்பாளர் மரபணுக்களில் 9 மரபணுக்கள் மறு-சோதனைக்குப் பிறகு குறிப்பிடத்தக்க பாகுபாட்டை வழங்கின. மூன்று பயாப்ஸி தரவுத்தொகுப்புகளின் சுயாதீன பகுப்பாய்வு முதல் ஐந்து மரபணுக்களை அடையாளம் கண்டுள்ளது. ஒவ்வொரு பகுப்பாய்விலும் மூன்று மரபணுக்கள் (IL13RA2, PTGS2 மற்றும் WNT5A) மிகவும் பயனுள்ள பாகுபாடு காட்டுகின்றன.

முடிவு: இந்த பகுப்பாய்வு IL13RA2, PTGS2 மற்றும் WNT5A ஐ அடையாளம் கண்டுள்ளது, IBD நோயாளிகளின் பெருங்குடல் திசுக்களில் உள்ள மூன்று மரபணுக்கள் IFX சிகிச்சைக்கு பதிலளிக்கும் மற்றும் பதிலளிக்காத நோயாளிகளுக்கு இடையே உள்ள பாகுபாட்டிற்கு ஏற்றது. இந்த மரபணுக்கள் குடல் நோய்க்குறியீட்டில் உள்ள புரதங்களை குறியாக்கம் செய்கின்றன; பதிலளிக்காத நோயாளிகளின் உயர் வெளிப்பாடு IBD சிகிச்சையில் முக்கியமான இலக்குகளைக் குறிக்கலாம்.