ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்
ஐ.எஸ்.எஸ்.என்: 0974-276X
ஐ.எஸ்.எஸ்.என்: 0974-276X
Ngo Tat Trung, Rudolf Engelke மற்றும் Gerhard Mittler
TMTCGCGANR (M என்பது C அல்லது A, R என்பது A அல்லது G, மற்றும் N ஏதேனும் ஒரு நியூக்ளியோடைடு) M8 எனப்படும் மையக்கருத்து 368 மனித மரபணு ஊக்குவிப்பாளர்களில் உள்ள சிஸ்-ரெகுலேட்டரி உறுப்பாகக் கண்டறியப்பட்டது. இவற்றில், 236 (64%) நான்கு தொடர்புடைய உயிரினங்களின் ஊக்குவிப்பு வரிசைகளுக்குள் பாதுகாக்கப்படுகின்றன: மனிதன், எலி, எலி மற்றும் நாய். இருப்பினும், M8 மையக்கருத்துடன் தொடர்பு கொள்ளும் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணிகள் (TFs) இன்னும் விவரிக்கப்படவில்லை. கொடுக்கப்பட்ட செயல்பாட்டு டிஎன்ஏ உறுப்புகளுடன் தொடர்புடைய டிஎஃப்களுக்கான ஸ்கிரீனிங் ஒரு வழிமுறையாக ஒரு-படி டிஎன்ஏ தொடர்பு சுத்திகரிப்புக்கு இணையான அளவு புரோட்டியோமிக்ஸ் பயன்பாட்டை நாங்கள் முன்பு தெரிவித்தோம். SILAC-லேபிளிடப்பட்ட அணுக்கரு சாற்றைப் பயன்படுத்துவதன் மூலமும், நன்கு வகைப்படுத்தப்பட்ட சிஸ்-ஒழுங்குமுறை மையக்கருத்துக்களைப் பயன்படுத்தியும் இந்த செயல்முறை இன்-விட்ரோ செய்யப்படுகிறது. அதைக் கட்டமைத்து, இந்த ஆய்வில், ஒரு-படி டிஎன்ஏ அஃபினிட்டி புல்-டவுன் சோதனைகளில் இருந்து தவறான நேர்மறை வெற்றிகளை வடிகட்ட, புள்ளிவிவர பகுப்பாய்வுடன் எங்கள் முறையை இணைத்துள்ளோம். இதன் விளைவாக துத்தநாக விரல் BED டொமைன் கொண்ட புரதம் 1 (ZBED1), ஆல்பா குளோபின் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி CP2 (TFCP2), அப்ஸ்ட்ரீம் பைண்டிங் புரதம் 1 (UBP) மற்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி CP2 போன்ற 1 (TFCP2L1) ஆகியவை குறிப்பிட்ட M8 ஊடாடும் காரணிகளாக அடையாளம் காணப்பட்டன. ChIP (குரோமாடின் இம்யூனோ-பிரிசிபிடேஷன்) மதிப்பீடுகளைப் பயன்படுத்தி M8-கொண்ட ஊக்குவிப்பாளர்களைக் கொண்ட தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட மரபணுக்களுக்கு ஆல்பா குளோபின் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி TFCP2 இன் விவோ பிணைப்பை நிரூபிக்கும் எங்கள் திரையைச் சரிபார்த்தோம். இது மரபணுக்களைக் கொண்ட M8 மையக்கருத்தை ஒழுங்குபடுத்துவதில் மேலே உள்ள புரதங்களின் செயல்பாட்டுப் பங்கைக் குறிப்பது மட்டுமல்லாமல், உயிரணுக்களில் நிகழும் புரதம்-டிஎன்ஏ இடைவினைகளைப் புரிந்துகொள்வதற்கான எங்கள் அணுகுமுறையின் சாத்தியமான பயன்பாட்டையும் பரிந்துரைக்கிறது.