ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்
ஐ.எஸ்.எஸ்.என்: 0974-276X
ஐ.எஸ்.எஸ்.என்: 0974-276X
வில்லியம் எஃப் போர்டோ, சிமோன் மரியா-நெட்டோ, டியாகோ ஓ நோலாஸ்கோ மற்றும் ஆக்டேவியோ எல் பிராங்கோ
புரத கட்டமைப்புகள் சில செயல்பாட்டு சான்றுகளை வழங்க முடியும். எனவே கற்பனையான புரதங்களின் செயல்பாடுகளை அடையாளம் காணும் கட்டமைப்பு மரபியல் முயற்சிகள் உயிரியல் அமைப்புகளைப் பற்றிய நமது புரிதலில் முன்னேற்றத்தைக் கொண்டு வந்துள்ளன. இந்த நோக்கத்திற்காக, செயல்பாட்டுக் கணிப்புக்கான வேட்பாளர்களைத் தேடுவதில் புரத தரவுத்தளங்களைச் சுரங்கப்படுத்துவதற்கான ஒரு புதிய உத்தி இங்கே விவரிக்கப்பட்டுள்ளது. NCBI இன் தேவையற்ற தரவுத்தளத்தில் டெபாசிட் செய்யப்பட்ட Escherichia coli புரதங்களுக்கு இந்த உத்தி பயன்படுத்தப்பட்டது. சுருக்கமாக, புரோட்டீன் டேட்டா பேங்கில் குறிப்பிடத்தக்க வார்ப்புருக்கள் இல்லாமல், டிரான்ஸ்மேம்பிரேன் பகுதிகள் இல்லாமல் மற்றும் யூகாரியோட் புரதங்களுடன் ஒற்றுமையுடன் சிறிய பாதுகாக்கப்பட்ட கற்பனை புரதங்களை தரவுச் செயலாக்கம் தேர்ந்தெடுக்கிறது. இந்த மூலோபாயத்தின் மூலம், மொத்தம் 13,306 E. coli இன் பாதுகாக்கப்பட்ட அனுமான வரிசைகளில் இருந்து 12 புரத வரிசைகள் மூலக்கூறு மாதிரியாக்கத்திற்காக தேர்ந்தெடுக்கப்பட்டன. இவற்றில் இருந்து, மூன்று காட்சிகளை மட்டுமே மாதிரியாக உருவாக்க முடியும். GI 488361128 மாதிரியானது குப்ரெடாக்ஸின்களைப் போலவே இருந்தது, GI 281178323 மாதிரியானது β-பேரல் புரதங்களைப் போன்றது மற்றும் GI 227886634 மாதிரியானது கொழுப்பு பிணைப்பு புரதங்களுடன் கட்டமைப்பு ஒற்றுமைகளைக் காட்டியது. இருப்பினும், GI 227886634 மட்டுமே ஒத்த கட்டமைப்புகளுடன் தொடர்புடைய செயல்பாட்டைக் கொண்டிருப்பதாகத் தெரிகிறது, ஏனெனில் இது மூலக்கூறு இயக்கவியல் உருவகப்படுத்துதலின் போது மடிப்பை வைத்திருக்கும் தனித்துவமான கட்டமைப்பாகும். இங்கு விவரிக்கப்பட்டுள்ள முறையானது, விட்ரோ மற்றும்/அல்லது விவோ செயல்பாட்டு குணாதிசயத்திற்கு இலக்காக இருக்கும் அனுமான வரிசைகளைத் தேர்ந்தெடுக்க பொருத்தமானதாக இருக்கலாம்.