ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

ரைபோசோம் பயோஜெனிசிஸ்: இரைப்பை புற்றுநோயின் எக்சோசோமில் ஒரு முக்கிய வீரர்

Chun-yan Lv, Xian-kui Cheng, Yuan Zhong, You-li Jian, Ming-ming He, Tao Lei

குறிக்கோள்: இரைப்பை புற்றுநோயை உருவாக்கும் செயல்முறையுடன் தொடர்புடைய இரத்தத்தில் உள்ள முக்கிய மரபணுக்களை அடையாளம் காணுதல் மற்றும் ஆரம்பகால நோயறிதல் மற்றும் புதிய புற்றுநோய் எதிர்ப்பு சிகிச்சைகள் மூலம் இறப்பு விகிதங்களைக் குறைக்க உதவுதல்.

முறை: இரைப்பை புற்றுநோய் (GC) மற்றும் ஆரோக்கியமான கட்டுப்பாடுகள் உள்ள நோயாளிகளின் இரத்த எக்ஸோசோம்களின் ரிபோ-நியூக்ளிக் அமிலங்கள் (ஆர்என்ஏக்கள்) தரவு, எக்ஸோஆர்பேஸ் தரவுத்தளத்திலிருந்தும், மெசஞ்சர் ஆர்என்ஏ (எம்ஆர்என்ஏ), நீண்ட குறியீட்டு அல்லாத ஆர்என்ஏ (எல்என்சிஆர்என்ஏ) மற்றும் வட்ட வடிவத்திலிருந்தும் குறைக்கப்பட்டது. RNA (circRNA) R மொழியைப் பயன்படுத்தி பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டது. பின்னர் தொடர்புடைய ஆர்என்ஏக்கள் மற்றும் அவற்றுடன் தொடர்புடைய மைக்ரோ ஆர்என்ஏ (மைஆர்என்ஏ) தரவு என்சைக்ளோபீடியா ஆஃப் ஆர்என்ஏ இன்டராக்டோம்ஸ் (என்கோரி), மைஆர்கோட் மற்றும் பிற தரவுத்தளங்களால் கணிக்கப்பட்டது, போட்டியிடும் எண்டோஜெனஸ் ஆர்என்ஏ (சிஆர்என்ஏ) நெட்வொர்க்கில் இறக்குமதி செய்யப்பட்டது. இறுதியாக, சிறுகுறிப்பு, காட்சிப்படுத்தல் மற்றும் ஒருங்கிணைக்கப்பட்ட கண்டுபிடிப்புக்கான தரவுத்தளமானது (DAVID) வித்தியாசமாக வெளிப்படுத்தப்பட்ட mRNA (DEmRNAகள்), ஜீன் ஆன்டாலஜி (GO) சிறுகுறிப்புகள் மற்றும் கியோட்டோ என்சைக்ளோபீடியா ஆஃப் ஜீன்ஸ் மற்றும் ஜீனோம்ஸ் (KEGG) பகுப்பாய்வு ஆகியவற்றை விசாரிக்க அணுகப்பட்டது.

முடிவுகள்: மொத்தம் 62 எம்ஆர்என்ஏக்கள், 3 எல்என்சிஆர்என்ஏக்கள் மற்றும் 15 சர்க்ஆர்என்ஏக்கள் வித்தியாசமாக வெளிப்படுத்தப்பட்டன. 192 mRNA முனைகள், 32 lncRNA முனைகள், 28 circRNA முனைகள் மற்றும் 152 miRNA முனைகள் உள்ளிட்ட சைட்டோஸ்கேப் மென்பொருளைக் கொண்டு ceRNA நெட்வொர்க் கட்டப்பட்டது, இதில் முதல் 10 ஹப் மரபணுக்கள் EMSY, ஜிங்க் ஃபிங்கர் ஈ-பாக்ஸ்-பைண்டிங் ஹோமியோபாக்ஸ் 2 (ZEB 2), அணுக்கரு ஏற்பி அழுத்த அழுத்தி (LCOR), 14A (MFSD 14A), ERBB2 இன்டராக்டிங் புரோட்டீன் (ERBB2IP), hsa-miR-363-3p, hsa-miR-137, hsa-miR-27a-3p, hsa-miR-23b-30rc300rc30 GO சிறுகுறிப்பு படி, உயிரியல் செயல்முறைகள் முக்கியமாக சைட்டோபிளாஸ்மிக் மொழிபெயர்ப்பில், உயிரணு கூறுகள் பெரும்பாலும் ரைபோசோம் மற்றும் அதன் துணை அலகு மற்றும் முக்கிய மூலக்கூறு செயல்பாடுகள் ரைபோசோமின் கட்டமைப்பு கூறுகளை உள்ளடக்கியது, முதலியன. DEmRNA முதன்மையாக mRNA கண்காணிப்பு பாதையில் செறிவூட்டப்பட்டதாக KEGG வெளிப்படுத்தியது. .

முடிவு: ஜிசியின் இரத்த எக்சோசோமில் ஒரு சிஆர்என்ஏ நெட்வொர்க் கட்டப்பட்டது, ஹப் மரபணுக்கள் திரையிடப்பட்டன, உயிரியல் செயல்முறை, செல் கூறு, மூலக்கூறு செயல்பாடு மற்றும் டிஎம்ஆர்என்ஏவின் செறிவூட்டல் பாதை ஆகியவை ஆராயப்பட்டன, இது ரைபோசோம் உயிரியக்கவியல் முக்கிய பங்கு வகிக்கிறது என்பதை நிரூபித்தது. இரைப்பை புற்றுநோயின் எக்ஸோசோம் மற்றும் இது GC நோயறிதலைச் செய்வதற்கும் சிகிச்சை அளிப்பதற்கும் துல்லியமான இலக்குகளை வழங்குகிறது.