ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

போட்டி எண்டோஜெனஸ் ஆர்என்ஏவின் கணக்கீட்டு கணிப்பு பற்றிய விமர்சனம்

ஷெரின் கே மற்றும் அச்சுத்சங்கர் எஸ். நாயர்

மைக்ரோஆர்என்ஏக்கள் (மைஆர்என்ஏக்கள்) என்பது எம்ஆர்என்ஏக்களின் 3' மொழிபெயர்க்கப்படாத பகுதிகளில் (யுடிஆர்கள்) மைக்ரோஆர்என்ஏ மறுமொழி கூறுகளுடன் (எம்ஆர்இக்கள்) பிணைக்கும் மரபணு ஒழுங்குமுறை மூலக்கூறுகள் ஆகும். மைஆர்என்ஏவின் அடக்குமுறை செயல்பாடு "மைஆர்என்ஏ கடற்பாசிகள்" அல்லது "போட்டியிடும் எண்டோஜெனஸ் ஆர்என்ஏக்கள் (சிஆர்என்ஏக்கள்)" ஆகியவற்றால் எதிர்க்கப்படுகிறது, ஏனெனில் மைஆர்என்ஏவின் விளைவைப் பிரிக்கும் அதன் போட்டித் தன்மையால் இது குறிப்பிடப்படுகிறது. ஒரு மைஆர்என்ஏவுக்கான பல எம்ஆர்இகளைக் கொண்ட சிஆர்என்ஏக்கள் அதிகமாக தொடர்பு கொள்கின்றன, இதன் விளைவாக ஒரு ஒழுங்குமுறை மரபணு நெட்வொர்க் அடுக்கு ஏற்படுகிறது. ceRNA நெட்வொர்க்கின் குழப்பம் புற்றுநோய் உட்பட பல்வேறு நோய்களை ஏற்படுத்துகிறது. இந்த கண்டுபிடிப்பு ceRNA இடைவினைகள், நெட்வொர்க்குகள் மற்றும் இயக்கவியல் ஆகியவற்றின் பகுப்பாய்வை அதிகரித்துள்ளது. தற்போது, ​​பல ceRNA-ceRNA தொடர்பு பகுப்பாய்வு மற்றும் கணிப்பு கருவிகள் ஆன்லைனில் கிடைக்கின்றன. இந்த மதிப்பாய்வு ceRNAகளாக செயல்படும் mRNA-mRNA ஜோடிகளின் கணக்கீட்டு கணிப்பு மற்றும் RNA சிகிச்சையில் அதன் முக்கியத்துவத்தின் மீது கவனம் செலுத்துகிறது. கணக்கீட்டு முன்கணிப்பு கருவிகள் மீட்டெடுக்கப்பட்ட உள்ளீட்டு தரவு, கருதப்படும் அம்சங்கள் மற்றும் கணிப்பு முறை ஆகியவற்றுடன் ஒப்பிடப்படுகின்றன.