ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

வேவ்லெட் சப்போர்ட் வெக்டார் மெஷின் அல்காரிதம் பயன்படுத்தி பாக்டீரியல் போரின்களில் சவ்வு விரியும் β இழைகளின் கணிப்பு

குவாங்-மிங் சியான்

பாக்டீரியல் போரின்களில் உள்ள டிரான்ஸ்மேம்பிரேன் β இழைகளின் துல்லியமான கணிப்புக்காக, WSVM அல்காரிதத்தின் பயன்பாட்டின் அடிப்படையில் பாக்டீரியா போரின்களில் உள்ள டிரான்ஸ்மேம்பிரேன் β இழைகளைக் கணிக்க அலை ஆதரவு திசையன் இயந்திரம் (WSVM) வழிமுறையை நாங்கள் முன்மொழிந்தோம். அறியப்பட்ட கட்டமைப்பின் அனைத்து ஐந்து போரின்களுக்கும் இந்த முறை பயன்படுத்தப்பட்டது (மூன்று பயிற்சி புரதங்கள், எஸ்கெரிச்சியா கோலியில் இருந்து போரின்கள், ரோடோபாக்டர் காப்சுலேட்டஸ் மற்றும் ரோடோப்சூடோமோனாஸ் பிளாஸ்டிக் மற்றும் இரண்டு சோதனை புரதங்கள், க்ளெப்சில்லா நிமோனியா மற்றும் கோமமோனாஸ் அசிடோவோரன்ஸ் ஆகியவற்றிலிருந்து போரின்). அனைத்து ஐந்து புரதங்களுக்கும் WSVM முறையானது பாக்டீரியல் போரின்களில் உள்ள டிரான்ஸ்மேம்பிரேன் இழைகளை சராசரியாக 84.9% துல்லியமாக கணித்துள்ளது, இது SVM (81.6%) மற்றும் RNFNN (78.8%) முறைகளை விட அதிக முன்கணிப்பு நிலை. SVM இன் சிறந்த சோதனை முடிவு, வேவ்லெட் கர்னலுடன் கூடிய பிரிசிக்டர் ஆகும், இது காசியன் RBF கர்னல், பாலினோமியல் கர்னல் மற்றும் லீனியர் கர்னல் ஆகியவற்றின் மற்ற மூன்று SVM கர்னல் செயல்பாட்டை விட 84.9% சிறந்தது, இது சராசரியாக 81.6%, 80.3%, மற்றும் 79. முறையே. சோதனை முடிவுகள் முன்மொழியப்பட்ட WSVM முறையின் செயல்திறனை நிரூபிக்கின்றன.