ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

கேதெப்சின் எல் புரதத்தின் முப்பரிமாண கட்டமைப்பின் கணிப்பு

சுனில் குமார், பிரியா ரஞ்சன் டெபாடா மற்றும் பிரகாஷ் சி. சுபாகர்

கேதெப்சின் எல் என்பது சிஸ்டைன் புரோட்டீஸ் ஆகும், இது கொலாஜன், எலாஸ்டின் மற்றும் ஃபைப்ரோனெக்டின் போன்ற இணைப்பு திசு புரதங்களை சிதைக்கிறது. வயதான சிறுநீரகத்தில் கேதெப்சின் எல் வெளிப்பாட்டின் அதிகரிப்பு முதுமையில் உறுப்புகளின் செயல்பாட்டை கணிசமாக இழக்க வழிவகுக்கிறது. SARS-CoV அல்லது SARS-CoV ஸ்பைக் புரோட்டீன்-சூடோடைப் செய்யப்பட்ட ரெட்ரோவைரஸ்கள் வைரஸ் நுழைவதற்கு எண்டோசோமால் கேதெப்சின் எல் புரோடீஸின் நொதி செயல்பாட்டைப் பயன்படுத்துகின்றன என்று சமீபத்தில் தெரிவிக்கப்பட்டது. ஹோமோ சேபியன்ஸ் (PDB குறியீடு: 1CS8) இலிருந்து ப்ரோகாதெப்சின் எல் இன் எக்ஸ்-ரே கட்டமைப்பைப் பயன்படுத்தி ஹோமோலஜி மாடலிங் மூலம் எலி கேதெப்சின் எல் இன் 3D அமைப்பு இந்த அறிக்கையில் உருவாக்கப்பட்டுள்ளது. MODELLER 9v2 மென்பொருளைப் பயன்படுத்தி ஹோமோலஜி மாடலிங் செய்யப்பட்டது. மூலக்கூறு இயக்கவியல் மற்றும் இயக்கவியல் முறையால் பெறப்பட்ட இறுதி மாதிரியானது, ப்ரோசெக் மற்றும் வெரிஃபை 3D வரைபடத்தால் மதிப்பிடப்பட்டது, இது இறுதி சுத்திகரிக்கப்பட்ட மாதிரி நம்பகமானது என்பதைக் காட்டுகிறது. புரதத்தை வகைப்படுத்துவதற்கு மாதிரியை மேலும் ஆராயலாம்.