ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்
ஐ.எஸ்.எஸ்.என்: 0974-276X
ஐ.எஸ்.எஸ்.என்: 0974-276X
சங்கீதா பாலசண்முகம்1*, சரவணன் கே2, குரு பிரசாத் எல்3, சிவகுமார் எஸ்4
செல் மக்கள்தொகை அடர்த்தியில் ஏற்படும் மாற்றங்களுக்கு பதிலளிக்கும் வகையில் மரபணு வெளிப்பாட்டின் கட்டுப்பாடு கோரம் சென்சிங் (QS) என அழைக்கப்படுகிறது. சூடோமோனாஸ் ஏருகினோசா என்று அழைக்கப்படும் பாக்டீரியம் மனிதர்களில் மரபணு டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனைக் கட்டுப்படுத்த QS ஐப் பயன்படுத்துகிறது. எனவே சூடோமோனாஸ் ஏருகினோசாவின் கட்டமைப்பு பண்புகளை பகுப்பாய்வு செய்வது அவசியம். புரதங்களின் இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்புகள் முதன்மை வரிசைகளின் இயற்பியல் செயல்முறைகளாக அடையாளம் காணப்பட்டுள்ளன, அவை செயல்பாட்டு மூன்றாம் நிலை கட்டமைப்புகளாக மடிகின்றன, அவை புரதங்கள் வாழ்க்கை அறிவியலின் உயிரியல் நிகழ்வுகளில் பங்கேற்க அனுமதிக்கின்றன. தொடர்புடைய அமினோ அமிலங்களின் வரிசையிலிருந்து புரத இரண்டாம் நிலைக் கட்டமைப்பின் கணிப்பு உயிர் தகவலியலில் முக்கியத்துவம் வாய்ந்தது மற்றும் இயந்திர கற்றல் அடிப்படையிலான வழிமுறைகளுக்கு இது ஒரு சவாலான பணியாகும். புரதத்தின் இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்பை கணிக்க NN ஐப் பயன்படுத்துவது ஒரு புதுமையான அணுகுமுறையாக இருந்தாலும், பிணைய உருவாக்கத்தின் போது இது சிக்கலானது. இந்தச் சிக்கலைச் சமாளிக்க, சினாப்டிக் எடைகளைப் பயிற்றுவிக்க கற்றல் அல்காரிதம் பயன்படுத்தப்படலாம். எனவே, இந்த வேலையில், QscR புரதத்தின் (Pseudomonas aeruginosa (PDB ID: 3 szT) இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்பு பகுப்பாய்வு PSO ட்யூன் செய்யப்பட்ட நரம்பியல் வலையமைப்பைப் பின்பற்றுவதன் மூலம் பெறப்படுகிறது. இது QscR புரதத்தின் 3 நிலை இரண்டாம் கட்டமைப்பைக் கணித்துள்ளது. அதிக துல்லியம் கொண்ட ஒற்றை புரத களம்.