குளோபல் ஜர்னல் ஆஃப் லைஃப் சயின்சஸ் மற்றும் உயிரியல் ஆராய்ச்சி
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

மனிதர்களில் Tp53 மரபணுவின் பைலோஜெனெடிக்ஸ் பகுப்பாய்வு மற்றும் மார்பக புற்றுநோயைக் கண்டறிவதற்கான பயோசென்சர்களில் அதன் பயன்பாடு

Sara da Silva Nascimento,Pierre Teodósio Félix*

பயோசென்சர்கள் இலக்கு பகுப்பாய்வுகளைக் கண்டறிய உயிரியல் எதிர்வினைகளைப் பயன்படுத்தும் சிறிய சாதனங்கள். இத்தகைய சாதனங்கள் ஒரு உயிரியல்
கூறுகளை இயற்பியல் மின்மாற்றியுடன் இணைக்கின்றன, இது உயிர் அங்கீகார செயல்முறைகளை அளவிடக்கூடிய சமிக்ஞைகளாக மாற்றுகிறது. அதன் பயன்பாடு
பல நன்மைகளைக் கொண்டுவருகிறது, ஏனெனில் அவை அதிக உணர்திறன் மற்றும் தேர்ந்தெடுக்கப்பட்டவை, வளர்ச்சியின் அடிப்படையில் ஒப்பீட்டளவில் எளிதானவை,
அத்துடன் அணுகக்கூடியவை மற்றும் பயன்படுத்த தயாராக உள்ளன. பயோசென்சர்கள்
உயிரணு ஏற்பிகள் மற்றும் ஆன்டிபாடிகள் போன்ற வினையூக்கமற்ற தசைநார் அல்லது மறைமுக கண்டறிதலைப் பயன்படுத்தி நேரடியாகக் கண்டறியலாம்
. அவை பயோ-அஃபினிட்டி சாதனங்களாகவும் தோன்றும்,
இலக்கு பகுப்பாய்வின் தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட பிணைப்பை மேற்பரப்பில் இணைக்கப்பட்ட லிகேட்டிவ் (எ.கா. ஒலிகோநியூக்ளியோடைடு ஆய்வு) சார்ந்தது.
மூலக்கூறு தரவுத்தளங்களில் டெபாசிட் செய்யப்பட்ட TP53 மரபணுவின் துண்டுகளில் இருக்கும் மரபணு வேறுபாட்டின் அளவை மதிப்பிடுவது
மற்றும் மார்பக புற்றுநோயைக் கண்டறிவதில் பயோசென்சராக அதன் நம்பகத்தன்மையை ஆய்வு செய்வது நோக்கங்களாகும் .
GENBANK இலிருந்து மனிதர்களின் TP53 மரபணுவின் 301 வரிசைகளை மீட்டெடுத்து பகுப்பாய்வு செய்வதே பயன்படுத்தப்பட்ட வழிமுறையாகும் , இது
MEGA மென்பொருள் பதிப்பு 6.06 உடன் இணைக்கப்பட்ட பிறகு, TREE-PUZZLE 5.2 ஐப் பயன்படுத்தி பைலோஜெனடிக் சிக்னலுக்காக சோதிக்கப்பட்டது. அதிகபட்ச வாய்ப்புள்ள மரங்கள்
PAUP பதிப்பு 4.0b10 மூலம் உருவாக்கப்பட்டன மற்றும் கிளைகளின் நிலைத்தன்மை
1000 போலி-பிரதிகளுடன் பூட்ஸ்ட்ராப் சோதனை மூலம் சரிபார்க்கப்பட்டது. சீரமைத்த பிறகு, 791 தளங்களில் 783 பாதுகாக்கப்பட்டது. காமா விநியோகம் 05 பிரிவுகள் + G ஐப் பயன்படுத்தி தளங்களுக்கிடையேயான பரிணாம விகிதங்களுக்கு (ஒரு தளத்திற்கு 0.90 0.96, 1.00, 1.04 மற்றும் 1.10 மாற்றீடுகள்)
அதிகபட்ச சாத்தியக்கூறுகள் குறைவாகவே இருந்தன .
ML மதிப்புகளை மதிப்பிடுவதற்கு,
இந்த கணக்கீட்டிற்கான அதிகபட்ச பதிவு -1058,195 உடன் ஒரு மர இடவியல் தானாகவே கணக்கிடப்படுகிறது. விடுபட்ட இடைவெளிகள் அல்லது தரவைக் கொண்ட அனைத்து நிலைகளும்
நீக்கப்பட்டன, இறுதி தரவுத்தொகுப்பில் மொத்தம் 755 தளங்கள் உள்ளன. பரிணாம
வரலாறு 500 பிரதிகளால் உருவாக்கப்பட்ட ஒருமித்த மரங்களால் குறிப்பிடப்படுகிறது, இது அண்டை-இணை மற்றும்
BioNJ வழிமுறைகளின் படி ஹாப்லோடைப்களுக்கு இடையில் குறைந்த தூரம் கொண்ட ஒரு அணியை அமைத்தது, இது
TP53 மரபணுவின் உயர் மட்ட பாதுகாப்பை உறுதிப்படுத்துகிறது.
மனித மக்கள்தொகையில் மார்பக புற்றுநோயைக் கண்டறிவதற்கான பயோசென்சர்களை உருவாக்குவதில் GENE TP53 ஒரு வலுவான வேட்பாளராகத் தெரிகிறது .