ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

புரோட்டியோமிக்ஸ் ஆய்வுகளில் வெளிப்புற அடிப்படையிலான வேறுபாடு வெளிப்பாடு பகுப்பாய்வு

Huy Vuong, Kerby Shedden, Yashu Liu மற்றும் David M Lubman

புற்றுநோய் பயோமார்க்கர் ஆராய்ச்சியில் ஒரு செயலில் உள்ள பகுதியானது, பாதிக்கப்பட்ட நபர்கள் முழுவதும் புற்றுநோயின் பன்முகத்தன்மையை பிரதிபலிக்கும் வெளிப்பாடு கையொப்பங்களை அடையாளம் காண்பதற்கான புள்ளிவிவர முறைகளின் வளர்ச்சி ஆகும். டாம்லின்ஸ் மற்றும் பலர். [5] பல புற்றுநோய் வகைகளுக்குள் ஆன்கோஜீன் செயல்பாட்டின் பன்முகத்தன்மை கொண்ட வடிவங்களைக் கண்டறிந்தது, மேலும் "புற்றுநோய் வெளிப்புற மரபணுக்களை" அடையாளம் காண புற்றுநோய் அவுட்லியர் சுயவிவர பகுப்பாய்வு (COPA) என்ற புள்ளிவிவர முறையை அறிமுகப்படுத்தியது. பல தொடர்புடைய புள்ளியியல் அணுகுமுறைகள் பின்னர் உருவாக்கப்பட்டுள்ளன, ஆனால் இந்த செயல்முறைகளின் இயக்க பண்புகள் (எ.கா. சக்தி, தவறான நேர்மறை விகிதம்), இன்னும் முழுமையாக வகைப்படுத்தப்படவில்லை, குறிப்பாக புரோட்டியோமிக்ஸ் அமைப்பில். இங்கே, சராசரி அடிப்படையிலான அணுகுமுறைகளை விட வெளிப்புற அடிப்படையிலான அணுகுமுறைகள் மிகவும் பயனுள்ளதாக இருக்க, வேறுபட்ட வெளிப்பாட்டின் வெளிப்புற வடிவத்தை எந்த அளவிற்கு வைத்திருக்க வேண்டும் என்பதை அடையாளம் காண உருவகப்படுத்துதலைப் பயன்படுத்துகிறோம். வால்கள் மற்றும் வெளிப்பாடு மதிப்புகளின் விநியோகத்தின் மையத்தில் வேறுபட்ட வெளிப்பாட்டின் சாத்தியமான சமமற்ற நிலைகளை வகைப்படுத்தும் ஒரு கண்டறியும் செயல்முறையையும் நாங்கள் முன்மொழிகிறோம். புரோட்டியோமிக்ஸ் ஆய்வுகளின் பொதுவான மாதிரி அளவுகள் மற்றும் விளைவு அளவுகளுக்கு, வெளிப்புற அடிப்படையிலான பகுப்பாய்வு அர்த்தமுள்ள பலனை வழங்குவதற்கு வெளிப்புற முறை வலுவாக இருக்க வேண்டும் என்பதைக் காண்கிறோம். ஒரு மெலனோமா ஆய்வின் புரோட்டியோமிக்ஸ் தரவுகளின் பகுப்பாய்வு மூலம் இது உறுதிப்படுத்தப்படுகிறது, இதில் வேறுபட்ட வெளிப்பாடு பெரும்பாலும் விநியோகம் முழுவதும் உள்ளது, மாறாக வால்களில் கவனம் செலுத்தாமல், வெளிப்புற வெளிப்பாட்டுடன் ஒத்துப்போகும் வெளிப்பாடு வடிவங்களைக் காட்டும் சில புரதங்களுடன்.