ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

NRPred-FS: அணுக்கரு ஏற்பிகளுக்கான அம்சத் தேர்வு அடிப்படையிலான இரண்டு-நிலை முன்கணிப்பு

Pu Wang and Xuan Xiao

உந்துதல்: அணுக்கரு ஏற்பிகள் (NRs) அனைத்து வளர்ச்சி மற்றும் உடலியல் செயல்முறைகளிலும் பங்கு வகிக்கின்றன மற்றும் பல்வேறு வகையான நோய் மற்றும் ஆரோக்கியமான நிலைகளில் முக்கியமான மருந்து இலக்குகளாகும். கடந்த ஆண்டுகளில், அதிக செயல்திறன் மற்றும் குறைந்த செலவில் NRகள் மற்றும் அவர்களின் துணைக் குடும்பங்களை அடையாளம் காண, பல இயந்திர கற்றல் முறைகள் அறிமுகப்படுத்தப்பட்டுள்ளன. இருப்பினும், இந்த முன்கணிப்புகள் அனைத்தும் நியூக்ளியர்ஆர்டிபியில் உள்ள பழைய தரவுத்தொகுப்பின் அடிப்படையில் உருவாக்கப்பட்டவை, மேலும் என்னவென்றால், எந்த அம்சத் தேர்வு நுட்பமும் பயன்படுத்தப்படவில்லை, இதனால் செயல்திறன் மிகவும் குறைவாகவே இருக்கும்.

முடிவு: இந்த ஆய்வில், NRPred-FS எனப்படும் அம்சத் தேர்வு அடிப்படையிலான இரண்டு-நிலை முன்கணிப்பு உருவாக்கப்பட்டது, இது வினவல் புரதத்தை அணுக்கரு ஏற்பியாகக் கண்டறியப் பயன்படுகிறது அல்லது அதன் வரிசைத் தகவலை மட்டும் அடிப்படையாகக் கொண்டிருக்காது, கணிப்பு பின்வரும் எட்டு துணைக் குடும்பங்களில் அதை மேலும் அடையாளம் காண தானாகவே தொடரும்: (1) தைராய்டு ஹார்மோன் (NR1), (2) HNF4 போன்ற (NR2), (3) ஈஸ்ட்ரோஜன் போன்றவை, (4) நரம்பு வளர்ச்சி காரணி IB-போன்ற (NR4), (5) Fushi tarazu-F1 போன்ற (NR5), (6) கிருமி செல் அணுக்கரு காரணி போன்ற (NR6), (7) knirps போன்ற (NR0A), மற்றும் (8) DAX போன்ற (NR0B). அணுக்கரு ஏற்பி வரிசைமுறைகள் பல்வேறு இயற்பியல் வேதியியல் மற்றும் புள்ளியியல் அம்சங்களை இணைத்து உருவாக்கப்பட்ட வரிசை-பெறப்பட்ட அம்ச திசையன்களாக குறியாக்கம் செய்யப்படுகின்றன. மேலும், அம்சங்களின் பரிமாணங்களைக் குறைப்பதற்கும் அதிக வகைப்படுத்தல் துல்லியத்தைப் பெறுவதற்கும் ஃபார்வர்ட் ஃபீச்சர் தேர்வு அல்காரிதம் மூலம் அம்சங்களின் தொகுப்பு உகந்ததாக இருக்கும். ஒரு ஆர்ப்பாட்டமாக, இந்த முறையானது நியூக்ளியர்ஆர்டிபி மற்றும் யூனிப்ரோட்டின் சமீபத்திய பதிப்பிலிருந்து பெறப்பட்ட தரவரிசை தரவுத்தொகுப்பில் கடுமையான சோதனைக்கு உட்பட்டது. லீவ்-ஒன்-அவுட் கிராஸ் சரிபார்ப்பின் ஒட்டுமொத்த கணிப்புத் துல்லியம் முதல் மற்றும் இரண்டாவது நிலைகளில் முறையே 97% மற்றும் 93% ஆகும். பயனர்களுக்கு வசதியாக, சக்திவாய்ந்த முன்கணிப்பு, NRPred-FS, http://www.jci-bioinfo.cn/NRPred-FS இல் இலவசமாக அணுக முடியும். NRகள் மற்றும் அவர்களின் துணைக் குடும்பங்களை அடையாளம் காண இது ஒரு பயனுள்ள வாகனமாக இருக்கும் என நம்புகிறோம்.