ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

குறைந்த/நடுநிலை pH நிலைகளில் மனித β-குளுக்கோசிடேஸில் N-octyl-β-valienamine இன் வேதியியல் சாப்பரோன் விளைவுகளின் மூலக்கூறு அடிப்படை

ஹிரோயுகி ஜோ, கட்சுயுகி யுகி, சீச்சிரோ ஒகாவா, யோஷியுகி சுஸுகி மற்றும் யசுபுமி சகாகிபரா

வேதியியல் சாப்பரோன் சிகிச்சை என்பது பிறழ்ந்த லைசோசோமால் ஹைட்ரோலேஸின் செயல்பாடுகளை மீட்டெடுப்பதற்கான ஒரு உத்தி ஆகும். இந்த சிகிச்சையானது செயலிழந்த என்சைம்களுடன் பிணைக்கும் இரசாயன கலவைகளை உள்ளடக்கியது. லைசோசோமால் ஹைட்ரோலேஸ்களுக்கான இரசாயன சேப்பரோன்கள் , நடுநிலை pH இல் பிணைப்பதன் மூலம் இலக்கு நொதிகளின் மடிப்புகளை நிலைநிறுத்தவும் மற்றும் லைசோசோமுக்கு கொண்டு சென்ற பிறகு அமில நிலைகளில் விலகல் மூலம் நொதி செயல்பாடுகளை மீட்பதாகவும் எதிர்பார்க்கப்படுகிறது . இருப்பினும், வேதியியல் சாப்பரோன்களின் செயல்பாட்டின் பொறிமுறையை விவரிக்கும் மூலக்கூறு அடிப்படை போதுமான அளவு பகுப்பாய்வு செய்யப்படவில்லை. மனித ?-குளுக்கோசிடேஸ் மற்றும் அதன் அறியப்பட்ட வேதியியல் சேப்பரோன், N-octyl-?-valienamine (NOV) ஆகியவற்றுக்கு இடையே உள்ள பிணைப்பு இலவச ஆற்றல் pH 5 ஐ விட pH 7 இல் குறைவாக உள்ளது என்பதைக் காட்டும் மூலக்கூறு இயக்கவியல் உருவகப்படுத்துதல்களிலிருந்து பெறப்பட்ட முடிவுகளை இங்கே வழங்குகிறோம். இந்த அவதானிப்பு இரசாயன சாப்பரோன்களின் அனுமான நடவடிக்கைக்கு இசைவானது. கணிக்கப்பட்ட pKa மதிப்புகளிலிருந்து தீர்மானிக்கப்பட்ட அயனியாக்கக்கூடிய எச்சங்களின் புரோட்டானேஷன் நிலைகளில் உள்ள வேறுபாடுகளாக pH நிலைகள் குறிப்பிடப்படுகின்றன. பிணைப்பு இல்லாத ஆற்றல் மாற்றம் GLU235, அமிலம்/அடிப்படை வினையூக்கியான GLU235 மற்றும் NOV இன் N அணுவிற்கும் இடையே உருவான ஹைட்ரஜன் பிணைப்புகளின் எண்ணிக்கையுடன் எதிர்மறையாக தொடர்புடையது. pH 7 இல், NOV ஆனது pH 5 ஐ விட செயலில் உள்ள தளத்தில் மேலும் செருகப்படுகிறது. இதன் விளைவாக, இது H-பத்திரங்களின் எண்ணிக்கையில் அதிகரிப்பை வழங்குகிறது. எனவே, pH 5 இல் ?-குளுக்கோசிடேஸில் இருந்து NOV இன் விலகல் பல எச்சங்களின் புரோட்டானேஷனால் ஏற்படும் பிணைப்பு இலவச ஆற்றல் மாற்றத்தின் அதிகரிப்பு காரணமாக ஏற்படுகிறது, இது NOV மற்றும் நொதிக்கு இடையில் உருவாகும் H- பிணைப்புகளின் எண்ணிக்கையைக் குறைக்கிறது.