ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

மைனிங் யூனிக்-எம் சப்ஸ்ட்ரிங்ஸ் ஃப்ரம் ஜெனோம்ஸ்

காய் யே, ஜென்யு ஜியா, யிபெங் வாங், பால் ஃபிலிசெக் மற்றும் ரோல்ஃப் அப்வீலர்

மரபணுக்களில் உள்ள தனித்த துணைச்சரங்கள், PCR, மைக்ரோஅரே ஹைப்ரிடைசேஷன், தெற்கு மற்றும் வடக்கு ப்ளாட்டிங், ஆர்என்ஏ குறுக்கீடு (ஆர்என்ஏஐ) மற்றும் ஜீனோம் (மறு) வரிசைப்படுத்துதல் போன்ற பல மரபியல் ஆய்வுகளுக்கு முக்கியமான மற்றும் அடிப்படையான உயர் மட்ட விவரக்குறிப்பைக் குறிக்கலாம் . எவ்வாறாயினும், மரபணுவில் மட்டும் தனித்தன்மை வாய்ந்த வரிசையாக இருப்பது உயர் விவரக்குறிப்புக்கு உத்தரவாதம் அளிக்க போதுமானதாக இல்லை. எடுத்துக்காட்டாக, ஒரு குறிப்பிட்ட சகிப்புத்தன்மையில் உள்ள நியூக்ளியோடைடுகள் பொருந்தாதது, மரபணுவில் ஒரு முறை மட்டுமே ஆர்வமுள்ள உட்கூறு ஏற்பட்டாலும் கூட, குறிப்பிட்ட தன்மையை பாதிக்கலாம். இந்த ஆய்வில், மரபணு அளவிலான மதிப்பீடுகளில் தனித்தன்மையைக் கட்டுப்படுத்த, மரபணுக்களின் தனித்துவமான-m உட்பிரிவுகளின் கருத்தை நாங்கள் முன்மொழிகிறோம். ஒரு தனித்துவமான-m சப்ஸ்ட்ரிங் என்பது முழு மரபணுவின் ஒரு இழையில் மட்டுமே ஒரு சரியான பொருத்தம் இருந்தால் மட்டுமே வரையறுக்கப்படுகிறது, மற்ற தோராயமான பொருத்தங்கள் m பொருந்தாதவைகளை விட அதிகமாக இருக்க வேண்டும். கொடுக்கப்பட்ட மரபணுவில் இருந்து இத்தகைய தனித்துவமான-m உட்பிரிவுகளை முறையாக சுரங்கப்படுத்த ஒரு முறை வளர்ச்சி அணுகுமுறையை நாங்கள் உருவாக்கியுள்ளோம். மற்ற போட்டி முறைகளுக்குத் தேவைப்படும் வரிசையான தகவலைப் பிரித்தெடுக்க, எங்கள் வழிமுறைக்கு முன் செயலாக்க படி தேவையில்லை. மரபணுக்களில் இருந்து தனித்துவமான-எம் சப்ஸ்ட்ரிங்ஸைத் தேடுவது வழக்கமான தரவுச் செயலாக்கத்தின் ஒரு பணியாகச் செய்யப்படுகிறது , இதனால் வினவல்களுக்கு இடையே உள்ள ஒற்றுமைகள் மிகப்பெரிய வேகத்தை அடையப் பயன்படுத்தப்படுகின்றன. எங்கள் அல்காரிதத்தின் இயக்க நேரம், உள்ளீட்டு மரபணுக்களின் அளவுகள் மற்றும் தனிப்பட்ட-m துணைச்சரங்களின் நீளம் ஆகியவற்றிற்கு நேர்கோட்டில் உள்ளது. கூடுதலாக, தனிப்பட்ட-m மைனிங் அல்காரிதம் ஒரு கிளஸ்டர் அல்லது பகிர்ந்த நினைவகத்துடன் கூடிய பல CPUகளின் ஒற்றை இயந்திரத்தில் மரபணு அளவிலான கணக்கீட்டை எளிதாக்குவதற்கு இணையாக மாற்றப்பட்டுள்ளது.