ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்
ஐ.எஸ்.எஸ்.என்: 0974-276X
ஐ.எஸ்.எஸ்.என்: 0974-276X
எரிக் சமோரோட்னிட்ஸ்கி, எமிலி கோஷ், சஹானா மஜூம்டர் மற்றும் சிபாஜி சர்க்கார்
ஆக்டிவேட்டர்கள் மற்றும் அடக்குமுறைகளின் பிணைப்பு மரபணு வெளிப்பாட்டின் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் ஒழுங்குமுறையில் குறிப்பிடத்தக்க பங்கைக் கொண்டுள்ளது. இந்த செயல்முறையின் செயல்திறனைக் கணிக்க மற்றும் தீர்மானிக்க அமைப்புகள் உயிரியல் அணுகுமுறை பயன்படுத்தப்பட்டது; இருப்பினும், பெரும்பாலான வேலைகள் புரோகாரியோடிக் அமைப்புகளில் செய்யப்படுகின்றன. எபிஜெனெடிக் ஒழுங்குமுறை டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் ஒழுங்குமுறையின் மற்றொரு பரிமாணத்தை வழங்குகிறது, இது மரபணுக்களின் குறியீட்டு பகுதியில் மாற்றங்களை உள்ளடக்காது. டிஎன்ஏ மெத்தில் டிரான்ஸ்ஃபெரேஸ் 1 (டிஎன்எம்டி1) என்சைம் மூலம் டிஎன்ஏவின் சிபிஜி தீவுகளில் குறிப்பிட்ட சிபிஜி எச்சங்களின் மெத்திலேஷன் மரபணு அமைதியை ஏற்படுத்துகிறது. புற்றுநோய் உயிரணுக்களில், டிஎன்எம்டி1 என்சைம் அதிகமாக வெளிப்படுத்தப்படுகிறது, மேலும் கட்டியை அடக்கும் மரபணுக்கள் உட்பட மரபணுக்களின் குறிப்பிட்ட தளங்களில் மெத்திலேஷன் நிலை உயர்த்தப்படுகிறது. இது புற்றுநோயை உருவாக்கும் கட்டியை அடக்கும் மரபணுக்களை அமைதிப்படுத்துகிறது. இருப்பினும், DNMT1 வெளிப்பாட்டின் அதிகரிப்பு மெத்திலேஷன் அளவின் அதிகரிப்புக்கு விகிதாசாரமாக உள்ளதா என்பது தெரியவில்லை. இக்கட்டுரையானது சாதாரண உயிரணுக்களை விட புற்றுநோய் உயிரணுக்களில் DNMT1 மிகவும் திறமையாக செயல்படுகிறதா என்பதை தீர்மானிக்க ஒரு கணினி உயிரியல் அணுகுமுறையை உருவாக்கியது. தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட எட்டு மரபணுக்களுடன் DNMT1 பிணைப்பின் ஒத்துழைப்பு, மாற்றியமைக்கப்பட்ட ஹில் சமன்பாட்டைப் பயன்படுத்தி நாள்பட்ட லிம்போசைடிக் லுகேமியா (CLL) செல்களில் தீர்மானிக்கப்பட்டது மற்றும் இந்த மதிப்புகளை சாதாரண லிம்போசைட்டுகள் மற்றும் கிரானுலோசைட்டுகளிலிருந்து பெறப்பட்ட மதிப்புகளுடன் ஒப்பிடுகிறது. DNMT1 இன் ஒத்துழைப்பு நான்கு புற்றுநோயுடன் தொடர்புடைய மரபணுக்களில் நேர்மறையாக இருப்பது கண்டறியப்பட்டது, அதேசமயம் அவற்றின் மதிப்புகள் சாதாரண லிம்போசைட்டுகள் மற்றும் கிரானுலோசைட்டுகள் இரண்டிலும் எதிர்மறையாக இருந்தது. டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் மரபணு ஒழுங்குமுறையின் பகுப்பாய்வில் கணினி உயிரியலை எவ்வாறு பயன்படுத்துவது என்பதை இந்த முடிவுகள் முதன்முறையாகக் காட்டுகின்றன. வளர்ச்சி மற்றும் பல்வேறு வகையான நோய்களில் மரபணு அளவிலான மெத்திலேஷனின் செயல்திறனை நிர்ணயிப்பதில் இந்த அணுகுமுறை பயனுள்ளதாக இருக்கும்.