ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

ஜுர்கட் டி லிம்போசைட் செல்களைப் பயன்படுத்தி சஸ்பென்ஷன்-பண்படுத்தப்பட்ட பாலூட்டி உயிரணுக்களுக்கான திரவ குரோமடோகிராபி-மாஸ் ஸ்பெக்ட்ரோமெட்ரி மெட்டபாலிக் மற்றும் லிபிடோமிக் மாதிரி தயாரிப்பு பணிப்பாய்வு

Candice Z Ulmer, Richard A Yost, Jing Chen, Clayton E Mathews மற்றும் Timothy J Garrett

வளர்சிதை மாற்றம் என்பது ஒரு உயிரினம் அல்லது உயிரியல் அமைப்புடன் தொடர்புடைய வளர்சிதை மாற்றத்தின் விரிவான ஆய்வு ஆகும். லிபிடோமிக்ஸ், வளர்சிதை மாற்றத்தின் துணைப்பிரிவு, செல்லுலார் லிப்பிட் செயல்பாடுகளின் ஆய்வை உள்ளடக்கியது: பாதைகள், நெட்வொர்க்குகள் மற்றும் இடைவினைகள் உட்பட. மெட்டாபொலிட்டுகள் மற்றும் லிப்பிட்களின் மிகுதியானது, ஆரோக்கியம் மற்றும் நோய்க்கான அவற்றின் பங்களிப்புடன், வளர்சிதை மாற்றத்தை பயோமார்க்கர் ஆராய்ச்சிக்கான மதிப்புமிக்க கருவியாக ஆக்குகிறது. நோய் பயோமார்க் அடையாளத்திற்கு மீண்டும் உருவாக்கக்கூடிய, உணர்திறன் மற்றும் துல்லியமான பகுப்பாய்வு தளம் தேவைப்படுகிறது. டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக் மற்றும் புரோட்டியோமிக் பகுதிகள் மாதிரி தயாரிப்பு மற்றும் தரவு செயலாக்கத்திற்கான நன்கு நிறுவப்பட்ட நெறிமுறைகளைக் கொண்டிருந்தாலும், வளர்சிதை மாற்றப் புலம் இன்னும் ஒப்பிடக்கூடிய தரப்படுத்தப்பட்ட மரபுகளை உருவாக்கி வருகிறது. மேலும், பாலூட்டிகளின் செல் கலாச்சாரங்களுக்குப் பயன்படுத்தப்பட்ட சில ஒப்பீட்டு LC-MS வளர்சிதை மாற்ற ஆய்வுகளில், பெரும்பாலானவை ஒட்டிய செல் கோடுகளை இலக்காகக் கொண்டுள்ளன. வணிக ரீதியாக கிடைக்கும் ஜுர்காட் டி லிம்போசைட்டுகளை ஒரு மாதிரி அமைப்பாகப் பயன்படுத்தி இடைநீக்கம் செய்யப்பட்ட பாலூட்டிகளின் உயிரணுக்களின் செல்லுலார் வளர்சிதை மாற்ற பகுப்பாய்வுக்கான மாதிரி தயாரிப்பு பணிப்பாய்வுகளை மேம்படுத்துவதே இந்த வேலையின் நோக்கமாகும். தற்போதைய விசாரணையானது, மறுஉருவாக்கம், துல்லியம் மற்றும் இலக்கற்ற பயோமார்க்கர் கண்டுபிடிப்புக்கான பொருந்தக்கூடிய தன்மை ஆகியவற்றிற்காக பொதுவாகப் பயன்படுத்தப்படும் மாதிரி தயாரிப்பு நுட்பங்களை மதிப்பீடு செய்தது. அயனி ஒடுக்கத்தை ஏற்படுத்தாமல் அல்லது செல்லுலார் மென்படலத்தின் ஒருமைப்பாட்டை பாதிக்காமல், மீடியாவில் உள்ள புற-செல்லுலார் கூறுகளை அகற்றுவதற்கான ஒரு சிறந்த வழிமுறையாக அம்மோனியேட்டட் செல் கழுவுதல் தீர்வுகள் இருப்பதாக முடிவுகள் காட்டுகின்றன. கூடுதலாக, ஒற்றை செல் துகள்களிலிருந்து பாலூட்டிகளின் இடைநீக்க உயிரணுக்களிலிருந்து வளர்சிதை மாற்றங்கள் மற்றும் லிப்பிட்களின் ஒருங்கிணைந்த பகுப்பாய்வு அனுமதிக்கும் வகையில் ஒரு புதிய பணிப்பாய்வு வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது. ஃபோல்ச் லிப்பிட் பிரித்தெடுத்தல் நெறிமுறையானது பாஸ்போலிப்பிட்கள் மற்றும் ட்ரையசில்கிளிசரைடுகளுக்கான உயர் பிரித்தெடுத்தல் செயல்திறனை உறுதி செய்வதற்காக 80% MeOH மெட்டாபொலைட் தனிமைப்படுத்தலுடன் இணைக்கப்பட்டது. பணிப்பாய்வு இடைநீக்கத்தில் உள்ள கலங்களுக்கு ஏற்ப வடிவமைக்கப்பட்டிருந்தாலும், அதை ஒட்டிய செல் கோடுகளுக்கும் பயன்படுத்தலாம்.