ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

ஜிசானியா (ஜிசானினே) இனத்தில் இரண்டு முழு பிளாஸ்டிட் மரபணுக்களுக்கு இடையே வரையறுக்கப்பட்ட பாலிமார்பிஸங்கள்

Zhiqiang Wu, Cuihua Gu, Luke R Tembrock மற்றும் Song Ge

சயனோபாக்டீரியாவிலிருந்து எண்டோசைம்பியோசிஸ் மூலம் உருவான பிளாஸ்டிடுகள், அவற்றின் சொந்த டிஎன்ஏ மரபணுவை (பிளாஸ்டோம்) கொண்டிருக்கின்றன, மேலும் அவை பெரும்பாலான தாவர இனங்களில் பரம்பரை பரம்பரையாக உள்ளன. இந்த ஆய்வில், பாரம்பரிய சாங்கர் சீக்வென்சிங் மூலம் பெறப்பட்ட மஞ்சூரியன் காட்டு அரிசியின் (ஜிசானியா லாட்டிஃபோலியா) முழுமையான பிளாஸ்டோம் வரிசையைப் புகாரளித்தோம், மேலும் அதே இனத்தைச் சேர்ந்த வட அமெரிக்க காட்டு அரிசியின் (Z. அக்வாடிகா) பிளாஸ்டோமுடன் ஒப்பிட்டுப் பார்த்தோம். Z. லாடிஃபோலியாவின் பிளாஸ்டோம் மொத்த வரிசை நீளம் 136,461 bp ஆகும், இதில் ஒரு ஜோடி 20,878 bp இன்வெர்டெட் ரிபீட்ஸ் (IRa, b) 82,115 bp மற்றும் ஒரு சிறிய ஒற்றை-நகல் பகுதியால் பிரிக்கப்பட்ட ஒரு ஜோடி உட்பட ஒரு வழக்கமான வட்ட அமைப்பை வெளிப்படுத்துகிறது. 12,590 பிபியின் நகல் பகுதி (SSC), அது 97 மட்டுமே வட அமெரிக்காவின் காட்டு அரிசியை விட பிபி நீளமானது. மரபணு உள்ளடக்கம், ஒழுங்கு மற்றும் நோக்குநிலை மற்ற அனைத்து புல் வகைகளையும் ஒத்திருக்கிறது. இரண்டு பிளாஸ்டோம் கட்டமைப்புகளில் உள்ள நான்கு சந்திப்புகள் ஜிசானியா இனங்களுக்கு இடையில் சரியாகவே உள்ளன. முழுமையான மரபணு ஒப்பீடுகளிலிருந்து, 744 (LSC, IR மற்றும் SSC க்கு 568, 46 மற்றும் 130) மாற்றீடுகள் இரண்டு ஜிசானியா பிளாஸ்டோம்களுக்கு இடையில் காணப்படுகின்றன, இதில் 267 குறியீட்டுப் பகுதிகளில் இருந்தும், 477 குறியீடு அல்லாத பகுதிகளிலிருந்தும் உள்ளன. செருகல்கள்/நீக்கங்கள் (இன்டெல்கள்) முக்கியமாக குறியீட்டு அல்லாத பகுதிகளில் (136) காணப்படுகின்றன. rpoC2 மரபணுவில் உள்ள குறியீட்டுப் பகுதிகளிலிருந்து ஒரே ஒரு மறுமுறை இன்டெல் தவிர. இரண்டு ஜிசானியா இனங்களுக்கிடையில் மிகவும் தகவலறிந்த பயோமார்க்ஸர்கள் (rps16-trnQ, ndhF மற்றும் matK) மிகவும் வேறுபட்டவை. இந்த இரண்டு ஜிசானியா இனங்களிலிருந்து முடிக்கப்பட்ட பிளாஸ்டோம் மற்றும் ஒப்பீட்டு பகுப்பாய்வுகள், ஜிசானினே துணைப்பிரிவு, மார்க்கர் உதவி இனப்பெருக்கம் மற்றும் பிளாஸ்டோமிக் மாற்றம் ஆகியவற்றில் மேலும் முறையான அல்லது மக்கள்தொகை மரபணு ஆய்வுகளுக்கு முக்கியமான ஆதாரமாக இருக்கும்.