ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

திரவ குரோமடோகிராபி-மாஸ் ஸ்பெக்ட்ரோமெட்ரி தரவுக்கான புரோட்டியோமிக்ஸ் பணிப்பாய்வு தரநிலைப்படுத்துவதற்கான ஊடாடும் இணைய கருவி

சுதிர் ஸ்ரீவஸ்தவா, மைக்கேல் மெர்ச்சன்ட், அனில் ராய் மற்றும் ஷேஷ் என். ராய்

அறிமுகம்: புரோட்டியோமிக்ஸ் சோதனைகள் பல படிகளை உள்ளடக்கியது மற்றும் பணிப்பாய்வுகளில் ஒவ்வொரு படிக்கும் பல தேர்வுகள் உள்ளன. எனவே, புரோட்டியோமிக்ஸ் பணிப்பாய்வுகளின் தரநிலைப்படுத்தல் என்பது புரோட்டியோமிக்ஸ் சோதனைகளின் வடிவமைப்பிற்கு இன்றியமையாத பணியாகும். இருப்பினும், தொழில்நுட்ப மாறுபாடு மற்றும் காணாமல் போன மதிப்புகள் காரணமாக பன்முகத்தன்மை போன்ற திரவ குரோமடோகிராபி-மாஸ் ஸ்பெக்ட்ரோமெட்ரி அடிப்படையில் அளவு அளவீடுகளுடன் தொடர்புடைய சவால்கள் உள்ளன.

முறைகள்: புரோட்டியோமிக்ஸ் பணிப்பாய்வு தரநிலையாக்க புரோட்டியோமிக்ஸ் பணிப்பாய்வு தரநிலைப்படுத்தல் கருவி (PWST) என்ற வலைப் பயன்பாட்டை நாங்கள் அறிமுகப்படுத்துகிறோம். சோதனையின் ஒவ்வொரு படிநிலைக்கும் மிகவும் பொருத்தமான தேர்வைத் தீர்மானிக்க கருவி உதவியாக இருக்கும். இது மாறுபாட்டின் குணகத்தை (CV) ஒப்பிடுவது போன்ற குறைந்த மாறுபாடுகளுடன் படிகள்/தேர்வுகளை அடையாளம் காண்பதை அடிப்படையாகக் கொண்டது. வகைப்படுத்தப்பட்ட மற்றும் தொடர்ச்சியான மாறிகள் கொண்ட தரவுகளில் கருவியை நாங்கள் நிரூபிக்கிறோம். பொதுவான நேரியல் மாதிரியின் சிறப்பு நிகழ்வுகள், கோவாரியன்ஸ் பகுப்பாய்வு மற்றும் நிலையான விளைவுகளுடன் மாறுபாட்டின் பகுப்பாய்வு ஆகியவை பல்வேறு மாறுபாடுகளின் மூலங்களால் ஏற்படும் விளைவுகளை ஆய்வு செய்ய பயன்படுத்தியுள்ளோம். ஒவ்வொரு மாறி மற்றும் CVக்கான சதுரங்களின் கூட்டுத்தொகையைக் கண்டறிய உதவும் பல்வேறு விருப்பங்களை நாங்கள் வழங்கியுள்ளோம். இல்லாத மதிப்புகளின் முன்னிலையில் கூட, புரதம் மற்றும் பெப்டைட் மட்டத்தில் தரவு மாறுபாட்டை பயனர் பகுப்பாய்வு செய்யலாம்.

கிடைக்கும் தன்மை மற்றும் செயல்படுத்தல்: "PWST"க்கான மூலக் குறியீடு R இல் எழுதப்பட்டு, https://ulbbf.shinyapps.io/pwst/ இலிருந்து இலவசமாக அணுகக்கூடிய பளபளப்பான வலைப் பயன்பாடாக செயல்படுத்தப்படுகிறது.