ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

குங்குமப்பூவில் வறட்சியைத் தாங்கும் EST களில் இருந்து EST-SSRகளின் சிலிகோ மைனிங்கில்

சுதாகர் சி*, திப்பேசுவாமி எம், சிவகுமார் எம், சுதாகர்பாபு ஓ, துதே எம்ஒய்

வறட்சி மன அழுத்தம் குங்குமப்பூவில் மகசூல் இழப்பை ஏற்படுத்தும் ஒரு முக்கிய அஜியோடிக் காரணியாகும் மற்றும் EST-SSR மட்டத்தில் மூலக்கூறு பொறிமுறையைப் பிரிக்க வரையறுக்கப்பட்ட ஆய்வுகள் மேற்கொள்ளப்பட்டுள்ளன. இந்த ஆய்வில், குங்குமப்பூ, Ct-D-EST, Ct-NEST மற்றும் Co-EST ஆகிய மூன்று EST நூலகங்களைப் பயன்படுத்தி எளிய வரிசைமுறைகள் (SSRs) விநியோகம் மற்றும் வறட்சி அழுத்தத்திற்கு இடையேயான சாத்தியமான தொடர்பு ஆய்வு செய்யப்பட்டது. Ct-D-EST ஆனது வறட்சியைத் தாங்கும் குங்குமப்பூ வகை A-1 இலிருந்து உருவாக்கப்பட்டது; Ct-N-EST மற்றும் Co-EST ஆகியவை முறையே குங்குமப்பூவின் EST தரவுத்தொகுப்புகள் மற்றும் அதன் காட்டுப் பிறவி C. oxycanthus ஆகும். மொத்தத்தில், 156 (45%), 1194 (5%) மற்றும் 1550 (9%) EST-SSRகள் முறையே Ct-D-EST, Ct-N-EST மற்றும் Co-EST நூலகங்களிலிருந்து வெட்டப்பட்டன. Ct-D-EST இலிருந்து EST-SSR களை மற்ற இரண்டு நூலகங்களின் SSR களுடன் ஒப்பிடுவது, ஒவ்வொரு வகுப்பின் மறுபரிசீலனைகளுக்கும் நியாயமான வேறுபாடுகளைக் காட்டியது. அனைத்து நூலகங்களிலும் டைனுக்ளியோடைடு மீண்டும் மீண்டும் வருவதற்கு பெரிய மாறுபாடுகள் காணப்பட்டன. வறட்சி EST-SSR களில், ஒரே ஒரு வகையான அமினோ அமிலம் ரிபீட் (ATG)14 மூலம் தயாரிக்கப்பட்டது, இது லோகியைக் குறிக்கும் குறியீடானது மற்றும் மீண்டும் 100% ஆகக் காணப்பட்டது. Ct-D-EST இலிருந்து SSRகள் கொண்ட மூன்று ESTகள், தூண்டக்கூடிய வேட்பாளர் மரபணுக்களுக்கு சிறுகுறிப்பு செய்யப்பட்டதால், S-adenosylmethionine சின்தேடேஸ், ஒன்-ஹெலிக்ஸ் புரதம் மற்றும் myo-inositol 1-பாஸ்பேட் சின்தேடேஸ், Ct-N-EST இல் SSRகளுடன் வெளிப்படுத்தவில்லை, இவை வறட்சி சகிப்புத்தன்மைக்கான சாத்தியமான வேட்பாளர் மரபணுக்களாக கருதப்படலாம். ஒரு டிரைனூசியோடிண்டே எஸ்எஸ்ஆர், என்கோடிங் மீட், ஈஎஸ்டியில் ஸ்-அடினோசில்மெதியோனைன் சின்தேடேஸுக்கு சிறுகுறிப்பு செய்யப்பட்டது, எனவே, இவை இரண்டும் வறட்சியைத் தாங்குவதற்கான குறியீடுகளாகக் கருதப்படலாம். இந்த ஆய்வில் உருவாக்கப்பட்ட மரபணு வளங்கள் மற்றும் தகவல்கள் குங்குமப்பூ வளர்ப்பவர்களுக்கு குறிப்பாக வறட்சியைத் தாங்கும் சாகுபடியின் வளர்ச்சிக்கு பயனுள்ளதாக இருக்கும்.