ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

கீரையின் ஆக்ஸிஜனேற்ற புரதங்களின் சிலிகோ பகுப்பாய்வு மற்றும் ஹோமோலஜி மாடலிங்

அர்ச்சனா சஹே மற்றும் மாத்வி ஷக்யா

கீரை ஒரு முக்கியமான உணவுக் காய்கறியாகும், இது பெரும்பாலும் நன்மை பயக்கும் ஆரோக்கிய விளைவுகளுடன் தொடர்புடையது. இந்த ஆய்வறிக்கையில், கீரை ஆக்ஸிஜனேற்ற புரதங்களின் பண்புகள் மற்றும் கட்டமைப்பை ஆராய ஒரு உயிர் தகவலியல் மற்றும் மூலக்கூறு மாடலிங் அணுகுமுறை ஏற்றுக்கொள்ளப்பட்டது. இந்த ஆய்வுக்கு தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட ஆக்ஸிஜனேற்ற புரதங்கள் அஸ்கார்பேட் பெராக்ஸிடேஸ் (APX), டீஹைட்ரோ அஸ்கார்பேட் ரிடக்டேஸ் (DHAR), பாஸ்போலிப்பிட் ஹைட்ரோபெராக்சைடு குளுதாதயோன் பெராக்ஸிடேஸ் போன்ற புரதம் (PHGPX) மற்றும் 2-Cys பெராக்சிரெடாக்சின் BAS1 (2-CPs). இயற்பியல்-வேதியியல் குணாதிசயம் pI, EC, AI, GRAVY மற்றும் உறுதியற்ற குறியீட்டு போன்ற பண்புகளை விளக்குகிறது மற்றும் இந்த புரதங்கள் மற்றும் அவற்றின் பண்புகள் பற்றிய தரவை வழங்குகிறது. செயல்பாட்டு குணாதிசயத்திற்காக மையக்கருத்துகள், வடிவங்கள், டிசல் ஃபை டி பாலங்கள் மற்றும் இரண்டாம் நிலை அமைப்பு ஆகியவற்றின் கணிப்பு செய்யப்பட்டது. இந்த புரதங்களுக்கான முப்பரிமாண கட்டமைப்புகள் PDB இல் இன்னும் கிடைக்கவில்லை. எனவே, இந்த ஆக்ஸிஜனேற்ற புரதங்களுக்கான ஹோமோலஜி மாதிரிகள் உருவாக்கப்பட்டன. இந்த புரதங்களின் முப்பரிமாண கட்டமைப்பின் மாடலிங், ஜெனோ3டி மற்றும் சுவிஸ் மாடல் ஆகியவற்றுடன் ஒப்பிடுகையில் மாடலரால் உருவாக்கப்பட்ட மாதிரிகள் மிகவும் ஏற்றுக்கொள்ளத்தக்கவை என்பதைக் காட்டுகிறது. புரோட்டீன் கட்டமைப்பு சோதனை கருவிகள் ப்ரோசெக் மற்றும் வாட் என்றால் மாதிரிகள் சரிபார்க்கப்பட்டன. இந்த கட்டமைப்புகள் சோதனை ரீதியாக பெறப்பட்ட படிக கட்டமைப்புகளின் செயல்பாட்டு பகுப்பாய்விற்கு ஒரு நல்ல அடித்தளத்தை வழங்கும்.