ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

அளவிடக்கூடிய மாடுலாரிட்டி அடிப்படையிலான கிளஸ்டரிங் பயன்படுத்தி உயிரியல் நெட்வொர்க்குகளின் மேம்படுத்தப்பட்ட செயல்பாட்டு செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வு

கொலின் மெக்லீன், சின் ஹீ, இயன் சிம்ப்சன் டி மற்றும் டக்ளஸ் ஆம்ஸ்ட்ராங் ஜே

கடந்த தசாப்தத்தில் உயிரியல் நெட்வொர்க்குகளில் இருந்து நுண்ணறிவைப் பிரித்தெடுப்பதற்கான கணித மற்றும் கணக்கீட்டு கருவிகளின் பயன்பாட்டில் விரைவான வளர்ச்சியைக் கண்டது , மேலும் இங்கு குறிப்பாக ஆர்வமாக, அத்தகைய நெட்வொர்க்குகளுக்குள் சமூகக் கட்டமைப்பைக் காட்சிப்படுத்துகிறது. க்ளஸ்டரிங் அணுகுமுறைகள் புரோட்டீன் இன்டராக்ஷன் நெட்வொர்க்குகளுக்குள் இருந்து கட்டமைப்பு மற்றும் செயல்பாட்டு துணைக் குழுக்களைக் கண்டறிய பயனுள்ள முறைகளை நிரூபித்துள்ளன. இருப்பினும், மூலக்கூறு நெட்வொர்க்குகளுக்குள் செயல்பாட்டுடன் தொடர்புடைய உட்கட்டமைப்புகளை அடையாளம் காண பொதுவாகப் பயன்படுத்தப்படும் பல கிளஸ்டரிங் முறைகள் நெட்வொர்க் அளவுகளை அதிகரிப்பதில் சிறப்பாக செயல்படவில்லை.

பல்வேறு அளவுகள் மற்றும் கணக்கீட்டு செயல்திறன் கொண்ட நெட்வொர்க்குகளுக்குள் செயல்பாட்டுடன் தொடர்புடைய துணை-கிளஸ்டர்களை அடையாளம் காணும் திறனின் அடிப்படையில் அல்காரிதம்களின் செயல்திறனை நாங்கள் சோதித்தோம். எங்கள் ஆய்வுகள் பல அல்காரிதம்கள் சிறிய நெட்வொர்க்குகளில் சிறப்பாக செயல்படுகின்றன, ஆனால் நெட்வொர்க் அளவுடன் அளவிட முடியவில்லை. ஸ்பெக்ட்ரல் அடிப்படையிலான மாடுலாரிட்டி கிளஸ்டரிங் அல்காரிதம், ஒரு சிறந்த-டியூனிங் படியுடன், உண்மையான புரோட்டியோமிக் இன்டராக்ஷன் தரவுத்தொகுப்புகளில் செயல்பாட்டு சிறுகுறிப்புக்காக (எ.கா. நோய்) செறிவூட்டப்பட்ட கிளஸ்டர்களின் அளவிடுதல் மற்றும் மேம்படுத்தப்பட்ட அடையாளம் ஆகிய இரண்டையும் வழங்குகிறது.