இம்யூனோதெரபி: திறந்த அணுகல்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

பசிபிக் சிப்பியின் இம்யூன் டிரான்ஸ்கிரிப்டுகள்: பாக்டீரியா சவாலின் விளைவாக வெளிப்பாட்டில் மாறும் க்ராசோஸ்ட்ரியா கிகாஸ் லார்வாக்கள்

ஜிங் ஃபாங், சியாவோஹுய் காய், ஃபெங்கி மாவோ, ஹோங்யு லி, ஹாங்லின் சென், மின்ஹுவா கியான், ஜேக்கப் ஆர். ஹாம்ப்ரூக், பேட்ரிக் சி. ஹானிங்டன், ஜின்ஜோங் வு

பின்னணி: கடல்சார் மொல்லஸ்க்குகள், சிப்பிகள் போன்ற அலைகள் மற்றும் கரையோரப் பகுதிகளில் வாழ்கின்றன, அவற்றின் வளர்ச்சியின் போது ஏராளமான நோய்க்கிருமி சவால்களை எதிர்கொள்கின்றன. விப்ரியோ அல்ஜினோலிடிகஸ் போன்ற பாக்டீரியாவிலிருந்து வரும் தொற்று , லார்வா வளர்ச்சியை பாதிக்கும் ஒரு முக்கிய காரணியாக உள்ளது மற்றும் அடிக்கடி பசிபிக் சிப்பி, க்ராசோஸ்ட்ரியா கிகாஸ் அதிக இறப்புக்கு வழிவகுக்கிறது . நோய்த்தொற்றின் விளைவுகளைத் தணிப்பதன் மூலம் வளர்ச்சியின் போது விலங்குகளைப் பாதுகாப்பதில் சிப்பி நோய் எதிர்ப்பு சக்தி முக்கிய பங்கு வகிக்கிறது.

முடிவுகள்: இந்த ஆய்வில், V. அல்ஜினோலிட்டிகஸ் சவாலுக்கு சி. கிகாஸ் லார்வாக்களின் நோயெதிர்ப்பு மறுமொழியின் விரிவான பகுப்பாய்வை நாங்கள் மேற்கொண்டோம் . லார்வா சி. கிகாஸின் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமை 0 மணிநேரத்தில் வரிசைப்படுத்தினோம், அதாவது லார்வா சிப்பி எந்த சிகிச்சையும் இல்லாமல் கட்டுப்பாடு மற்றும் 6, 12, 24, 48 மற்றும் 72 மணிநேரத்திற்கு பிந்தைய தொற்று. RNA-seqக்குப் பிறகு, PRJNA623063 என்ற அணுகல் எண்ணின் கீழ் NCBI சீக்வென்ஸ் ரீட் காப்பகத்தின் மூலம் மூல ரீட்கள் கிடைக்கும். வடிகட்டலுக்குப் பிறகு, சி. கிகாஸின் குறிப்பு மரபணுவைப் பயன்படுத்தி மொத்தம் 58.24 ஜிபி சுத்தமான ரீட்கள் தயாரிக்கப்பட்டு அசெம்பிள் செய்யப்பட்டன . தரமான Q30 இன் விநியோகம் ஒவ்வொரு மாதிரிக்கும் 90.88% ஐ விட அதிகமாக இருந்தது மற்றும் GC உள்ளடக்கம் 41.27% முதல் 42.91% வரை இருந்தது. COG, GO, KEGG, Swiss-Prot மற்றும் NR தரவுத்தளங்களின் வரிசைகளுடன் ஒப்பிடும்போது, ​​1,267, 1,112, 2,187, 682, 1,133 வித்தியாசமாக வெளிப்படுத்தப்பட்ட மரபணுக்கள் முறையே 6, 12, 272, 48, 48, 272 மணிநேரத்தில் குறிப்பிடப்பட்டுள்ளன. . நோயெதிர்ப்பு தொடர்பான பல மரபணுக்கள் காலப்போக்கில் மாறுபட்ட வெளிப்பாட்டைக் காட்டுகின்றன: டோல்-போன்ற ஏற்பிகள், முத்தரப்பு மையக்கரு புரதங்கள், லெக்டின் போன்ற காரணிகள், ஸ்காவெஞ்சர் ஏற்பிகள், மைலாய்டு வேறுபாடு காரணி 88 போன்ற சமிக்ஞை பாதை கூறுகள் மற்றும் வெப்ப அதிர்ச்சி 70 kDa புரதம் போன்ற அழுத்த புரதங்கள். உடன் ஒப்பிடும்போது V. அல்ஜினோலிட்டிகஸ் சவாலைத் தொடர்ந்து மிகுதியாக அதிகமாக இருப்பது கண்டறியப்பட்டது கட்டுப்பாடு. பகுப்பாய்விற்காக, இந்த மரபணுக்கள் முறை அங்கீகாரம் ஏற்பிகள், ஃபைப்ரினோஜென் போன்ற புரதங்கள், சேதத்துடன் தொடர்புடைய மூலக்கூறு வடிவங்கள், நிரப்பு காரணிகள் போன்ற பல வகைகளாகப் பிரிக்கப்பட்டன. சி. கிகாஸ் லார்வாக்களில் பல குறைந்த-ஒழுங்குபடுத்தப்பட்ட நோயெதிர்ப்பு தொடர்பான மரபணுக்களையும் நாங்கள் முதலில் கண்டுபிடித்துள்ளோம். TRIM2, TRIM45, TRIM56 போன்ற நோய்த்தொற்று ஏற்பட்ட முதல் 72 மணிநேரத்தில் TRIM71, மேக்ரோபேஜ் மேனோஸ் ஏற்பி 1, அபோலிபோபுரோட்டீன் D, சைட்டோக்ரோம் P450, Rho தொடர்பான புரதம், அழுத்தத்தால் தூண்டப்பட்ட புரதம் 1, HSP68 , HSP75 , HSP70 B2, ஹீம்-பைண்டிங் புரதம் 1, ஹீம்-பைண்டிங் புரதம் 2, ஹெவி-பைண்டிங் புரதம், ஹெவி மெட்டல்- ஹெமிசென்டின்-1, முதலியன இந்த பொது வகைகளை உருவாக்க எங்களுக்கு அனுமதித்தது நோய்த்தொற்றின் முதல் 72 மணிநேரத்தில் சி.கிகாஸிற்கான நோயெதிர்ப்பு மறுமொழி சுயவிவரம் . இந்த முடிவுகள் பாக்டீரியா தொற்று C. கிகாஸ் லார்வாக்களில் நோயெதிர்ப்பு மரபணு வெளிப்பாட்டின் சிக்கலான வடிவத்தைத் தூண்டுகிறது என்பதைக் குறிக்கிறது .

முடிவு: முதுகெலும்பில்லாத நோயெதிர்ப்பு மூலக்கூறுகளின் பன்முகத்தன்மை மற்றும் பரிணாமத்தை விளக்கும் மற்றும் சிப்பி கலாச்சாரத்தின் செயல்திறனை மேம்படுத்துவதற்கான பயனுள்ள நடவடிக்கைகளின் வளர்ச்சிக்கு வழிவகுக்கும் குறிப்பிட்ட நோயெதிர்ப்பு காரணிகளின் செயல்பாடு குறித்த இலக்கு விசாரணையை எங்கள் ஆய்வு எளிதாக்கும்.