ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

ஃபெசண்ட் மற்றும் காடையில் இருந்து ஏவியன் பீட்டா-டிஃபென்சின் 2 பெப்டைட்களின் அடையாளம் மற்றும் கட்டமைப்பு தன்மை

எல் கண்ணன், ஆர் லியனகே, ஜேஓ லே ஜூனியர், பி பாக்கியலட்சுமி, என் பி அந்தோனி மற்றும் என்சி ரத்

ஏவியன் β-Defensin 2 (AvBD2) இன் ஃபெசண்ட் மற்றும் காடை எலும்புகள் மேட்ரிக்ஸ்-அசிஸ்டெட் லேசர் டிஸார்ப்ஷன் அயனிசேஷன் டைம்-ஆஃப்-ஃப்ளைட் ( MALDI-TOF ) மாஸ் ஸ்பெக்ட்ரோமெட்ரி (எம்எஸ்), ஒப்பீட்டு விவரக்குறிப்பு மற்றும் இரசாயன விவரக்குறிப்பு ஆகியவற்றைப் பயன்படுத்தி ஹெட்டோரோபில் சாற்றை திரையிடுவதன் மூலம் அடையாளம் காணப்பட்டது. . ஒவ்வொரு ஃபெசன்ட் மற்றும் காடையின் ஹீட்டோரோபில் சாற்றில், முறையே m/z 4114.8 மற்றும் 4163.8 க்கு ஒத்த ஒரு உயர் தீவிரம் கொண்ட வெகுஜன உச்சத்தை நாங்கள் கவனித்தோம், இது 3 இன்டர்னல் டிஸல்பைட்டின் மாற்றத்தைக் குறிக்கும் 348 Da வெகுஜன வேறுபாட்டின் குறைப்பு மற்றும் அல்கைலேஷன் மூலம் மாற்றப்பட்டது. இந்த பெப்டைட்களில் இருக்கும் பிணைப்புகள். மாற்றப்படாத பெப்டைடுகள், m/z 4114 மற்றும் 4163 மற்றும் அவற்றின் கார்பமிடோமெதிலேட்டட் ( CAM ) வழித்தோன்றல்கள் தலைகீழ் நிலை HPLC மூலம் சுத்திகரிக்கப்பட்டன. சுத்திகரிக்கப்பட்ட பெப்டைட்களைப் பயன்படுத்தி, டிரிப்சின் செரிமானம் மூலம் அவற்றின் பகுதி வரிசைகளை நாங்கள் தீர்மானித்தோம், அதைத் தொடர்ந்து MALDI-TOF-MS, MALDI LIFT-TOF/TOF, மற்றும் Edman degradation ஆகியவை மற்ற AvBD2 உடன் தெளிவற்ற ஒத்திசைவைக் காட்டியது. அனைத்து முடிவுகளையும் ஒருங்கிணைத்து, பிற பறவை இனங்களிலிருந்து முதிர்ந்த AvBD2 உடன் நீட்டிக்கப்பட்ட வரிசையை சீரமைத்து, ஃபெசன்ட் மற்றும் காடை ஆர்த்தோலாஜ்களின் அமினோ அமில வரிசைகளை LFCKRGSCHFGRCPSHLIKVGSCFGFRSCCKWPWNA மற்றும் LFCRRGTCHFGNCPNCPRGFGN முறையே. இந்த வரிசை தகவல் MALDI இன்-சோர்ஸ் டிகே (ISD) பகுப்பாய்வுகளால் மேலும் உறுதிப்படுத்தப்பட்டது. ஃபெசன்ட் மற்றும் காடை AvBD2 பெப்டைடுகள் இரண்டும் மற்ற அறியப்பட்ட AvBD2 வரிசைகளுடன் குறிப்பிடத்தக்க அடையாளங்களைக் (>80%) காட்டின.