ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

மேட்ரிக்ஸ்-அசிஸ்டெட் லேசர் டிசார்ப்ஷன்/அயனியாக்கம் மூலம் ரைசோபியாவை அடையாளம் காணுதல் மற்றும் வகைப்படுத்துதல்

ரூய் சோங் ஜியா, ரோங் ஜுவான் ஜாங், குயிங் வெய், வென் ஃபெங் சென், இல் கியூ சோ, வென் சின் சென் மற்றும் கிங் எக்ஸ் லி

மாஸ் ஸ்பெக்ட்ரோமெட்ரி (MS) புரதங்களின் குறிப்பிட்ட, உணர்திறன் மற்றும் விரைவான பகுப்பாய்வுக்காக பரவலாகப் பயன்படுத்தப்படுகிறது மற்றும் பாக்டீரியா அடையாளம் மற்றும் குணாதிசயத்திற்கான உயர் திறனைக் காட்டியுள்ளது. நான்கு வகையான ரைசோபியா மற்றும் எஸ்கெரிச்சியா கோலை DH5α வகை விகாரங்கள், மேட்ரிக்ஸ்-உதவி லேசர் டெஸார்ப்ஷன்/அயனியாக்கம் MS (MALDI-TOF) மூலம் ரைசோபியாவின் வகைகளை அடையாளம் காணவும் வகைப்படுத்தவும் பல்வேறு அளவுருக்களை மேம்படுத்துவதற்கு குறிப்பு பாக்டீரியாக்களாகப் பயன்படுத்தப்பட்டன. உகந்த அளவுருக்கள் கலாச்சார நடுத்தர நிலைகள் (திரவ அல்லது திட), பாக்டீரியா வளர்ச்சி கட்டங்கள், காலனி சேமிப்பு வெப்பநிலை மற்றும் கால அளவு, மற்றும் பாக்டீரியா அடையாள தீர்மானம், துல்லியம் மற்றும் நம்பகத்தன்மையை மேம்படுத்த புரத தரவு செயலாக்கம் ஆகியவை அடங்கும். நடுத்தர நிலை புரத சுயவிவரங்களின் வெகுஜன நிறமாலையில் சிறிய விளைவுகளை ஏற்படுத்தியது. ஒரு பொருத்தமான மாதிரி நேரம் அதிவேக கட்டத்திற்கும் நிலையான கட்டத்திற்கும் இடையில் இருந்தது. 14 நாட்களுக்கு முன்பே வளர்ந்த ஈ.கோலி காலனிகளுக்கும், ரைசோபியாவிற்கு 21 நாட்களுக்கு 4°C அல்லது 21°C க்கும் நிலையான புரத நிறை நிறமாலை விவரங்கள் காணப்பட்டன. MALDI-TOF மாஸ் ஸ்பெக்ட்ராவின் அடிப்படையில் 4 வகைகளின் 75 ரைசோபியல் விகாரங்களின் டென்ட்ரோகிராம் கட்டப்பட்டது மற்றும் இடவியல் வடிவங்கள் 16S rDNA பைலோஜெனடிக் மரத்தில் உள்ளவற்றுடன் நன்றாக ஒத்துப்போகின்றன. அனைத்து ரைசோபியா இனங்களுக்கும் மாஸ் ஸ்பெக்ட்ரல் தரவுத்தளத்தை உருவாக்கும் திறன் குருட்டு மாதிரிகள் மூலம் மதிப்பிடப்பட்டது. மாதிரி தயாரிப்பதில் இருந்து துல்லியமான அடையாளம் மற்றும் இனங்களின் வகைப்பாடு வரை முழு செயல்முறைக்கும் தோராயமாக ஒரு மணிநேரம் தேவைப்படுகிறது.