ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

கிராப் பிரேக்: நெட்வொர்க் சமூக அடிப்படையிலான ஒழுங்குமுறை மருத்துவம், மரபணு இணை வெளிப்பாடு, இணைப்பு சமநிலையற்ற பகுப்பாய்வு, செயல்பாட்டு சிறுகுறிப்பு மற்றும் பலவற்றிற்கான கருவி

அபிஷேக் நரேன் சிங்*

வரைபட நெட்வொர்க் அறிவியல் பெருகிய முறையில் பிரபலமடைந்து வருகிறது, குறிப்பாக பெரிய தரவுக் கண்ணோட்டத்தில் தனிப்பட்ட செயல்பாட்டு பாத்திரங்களுக்கான தனிப்பட்ட நிறுவனங்களைப் புரிந்துகொள்வது சிக்கலானது மற்றும் நேரத்தை எடுத்துக்கொள்ளும். மரபணு மாறுபாடுகளின் தொகுப்பால் மரபணுக்களின் தொகுப்பு கட்டுப்படுத்தப்படும் போது, ​​மரபணுக்கள் தொகுப்பு பொதுவான அல்லது தொடர்புடைய செயல்பாட்டு நோக்கத்திற்காக ஆட்சேர்ப்பு செய்யப்படும். சங்கங்களின் வலையமைப்பிலிருந்து சமூகங்களைத் தொகுத்தல் மற்றும் பிரித்தெடுத்தல் அமைப்பின் சிக்கலைப் புரிந்துகொள்வதற்கு முக்கியமானதாகிறது, இதனால் நோய் மற்றும் செயல்பாட்டு சங்கங்களுக்கான மரபணுக்களுக்கு முன்னுரிமை அளிக்கிறது. ஒரு நேரத்தில் நிறுவனங்களைப் படிக்கும்போது பணிச்சுமை குறைகிறது. இதற்காக, மரபணு ஒருங்கிணைப்பு, புரத தொடர்பு, ஒழுங்குமுறை நெட்வொர்க் போன்ற சமூகக் கண்டறிதல் பயன்பாட்டிற்கான கருவிகளின் தொகுப்பான GraphBreak ஐ வழங்குகிறோம். eQTLs ஒழுங்குமுறை மரபணு நெட்வொர்க் சமூகத்தின் பயன்பாட்டிற்காக உருவாக்கப்பட்டிருந்தாலும், ஆய்வு முடிவுகள் எங்களுடன் காட்டப்பட்டுள்ளன. மாதிரி eQTL தரவுகளுடன் கூடிய பகுப்பாய்வு - உள்ளீட்டுத் தரவு தேவையான வடிவத்தில் வழங்கப்பட்டிருந்தால், மற்ற ஆய்வுகளுக்கு GraphBreak பயன்படுத்தப்படலாம், மரபணு இணை வெளிப்பாடு நெட்வொர்க்குகள், புரதம்-புரத தொடர்பு நெட்வொர்க், சமிக்ஞை பாதை மற்றும் வளர்சிதை மாற்ற நெட்வொர்க் உட்பட. கண்டறியப்பட்ட சமூகங்களின் நோய்த் தொடர்பிற்கான அதன் கீழ்நிலை பகுப்பாய்வில் கிராப் பிரேக் முக்கியமான பயன்பாட்டு வழக்கு மதிப்பைக் காட்டியது. சமூகக் கண்டறிதல் மற்றும் பகுப்பாய்வின் அனைத்து சுயாதீனமான படிகளும் அல்காரிதத்தின் ஒரு படிப்படியான துணைப் பகுதியாக இருந்தால். GraphBreak ஆனது சமூக அடிப்படையிலான செயல்பாட்டு குணாதிசயத்திற்கான ஒரு புதிய வழிமுறையாகக் கருதப்படலாம். இந்த நோக்கத்திற்காக பல்வேறு அல்காரிதம் செயல்படுத்தல் தொகுதிகளை ஒரே ஸ்கிரிப்ட்டில் இணைப்பது GraphBreak இன் புதுமையை விளக்குகிறது. மற்ற ஒத்த கருவிகளுடன் ஒப்பிடும்போது, ​​GraphBreak மூலம், நோய்களுடனான புள்ளிவிவரத் தொடர்புக்காக அதன் உறுப்பினர் மரபணுக்களை அதிகமாகப் பிரதிநிதித்துவப்படுத்தும் சமூகங்களை நாம் சிறப்பாகக் கண்டறிய முடியும், எனவே, போதைப்பொருள்-நிலைப்படுத்துதல் அல்லது போதைப்பொருள் இடமாற்றம் ஆகியவற்றிற்கு முன்னுரிமை அளிக்கக்கூடிய மரபணுக்களை இலக்கு வைக்கலாம்.