ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

GExMap: வித்தியாசமாக வெளிப்படுத்தப்பட்ட மரபணுக்களின் மைக்ரோஅரே-உருவாக்கப்பட்ட பட்டியல்களில் மரபணு விநியோகத்தைக் கண்டறிந்து பகுப்பாய்வு செய்வதற்கான ஒரு உள்ளுணர்வு காட்சி கருவி

நிக்கோலஸ் காக்னார்ட், கார்லோ லுச்சேசி மற்றும் கில்லஸ் சியோச்சியா

உயர் செயல்திறன் தொழில்நுட்பங்கள், டிஎன்ஏ மைக்ரோ அரேய்களாக, பெரிய அளவிலான தரவை உருவாக்குகின்றன, அவை விளக்குவது கடினம். உயிரியலாளர்களுக்கு அவற்றைப் பகுப்பாய்வு செய்வதற்கும் புதிய அறிவியல் கருதுகோள்களை ஆராயவும் பயன்படுத்த எளிதான கருவிகள் தேவைப்படுகின்றன. வேறுபட்ட வெளிப்பாடு ஆய்வுகள் மூலம் உருவாக்கப்பட்ட மரபணு பட்டியல்களில் புதைக்கப்பட்ட புதிய வகை பயனுள்ள மரபணு தகவல்களைப் பிரித்தெடுக்க காட்சி தரவுச் செயலாக்கக் கருவியை நாங்கள் முன்மொழிகிறோம். மரபணு பட்டியலில் காணப்படும் மரபணு விநியோகத்தை எதிர்பார்க்கப்படும் விநியோகத்துடன் ஒப்பிடுகிறோம், இது பொது மரபணு தரவுத்தளங்களிலிருந்து மதிப்பிடப்படுகிறது. ஆராய்ச்சியின் வழிமுறை மற்றும் புள்ளிவிவர சோதனை நம்பகமான மற்றும் உகந்த முடிவுகளை அளிக்கிறது. GExMap மரபணுப் பகுதிகளை அடையாளம் காண உதவுகிறது, அவை மரபணுக்களில் செறிவூட்டப்பட்டுள்ளன , அவற்றின் வேறுபட்ட வெளிப்பாடு இலக்கு நோய்களுக்கு ஆர்வமாக உள்ளது. இந்த மென்பொருள் இலவசமாகக் கிடைக்கிறது மற்றும் எளிதில் தனிப்பயனாக்கப்படுகிறது. ஆதாரங்கள் அடிக்கடி புதுப்பிக்கப்படுவதால், எந்த நேரத்திலும் புதுப்பிப்பதற்கான கருவிகளை இது வழங்குகிறது. GExMap வணிக ரீதியாகவும் பொதுவில் கிடைக்கக்கூடிய மைக்ரோஅரே இயங்குதளத்திலும் பயன்படுத்தக்கூடியது. மேலும், GExMap ஒவ்வொரு ஜீன் ஆன்டாலஜிக்கும் வரிசைப்படுத்தப்பட்ட பட்டியலைக் காண்பிப்பதன் மூலம் விளக்கமளிக்க உதவுகிறது. தற்போது, ​​GExMap ஆனது ஹோமோ சேபியன்ஸ் மரபணுவிலிருந்து மட்டுமல்லாமல், Mus musculus மற்றும் Rattus norvegicus மரபணுக்களிலிருந்தும் மரபணு பட்டியல்களை பகுப்பாய்வு செய்யப் பயன்படுகிறது.