ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்
ஐ.எஸ்.எஸ்.என்: 0974-276X
ஐ.எஸ்.எஸ்.என்: 0974-276X
Runxuan Zhang, Alun Barton, Julie Brittenden, Jeffrey T. -J. ஹுவாங் மற்றும் டேனியல் க்ரோதர்
லேபிள்-ஃப்ரீ ஷாட்கன் புரோட்டியோமிக்ஸ் என்பது ஒரு பெரிய அளவிலான மாதிரிகளை ஒரே பரிசோதனையில் ஒப்பிடும் திறன் கொண்ட ஒரு நம்பிக்கைக்குரிய அரை-அளவு புரோட்டீன் ப்ரோஃபைலிங் முறையாகும். இந்த புரோட்டியோமிக்ஸ் அணுகுமுறையில் உள்ள முக்கிய சவால்களில் ஒன்று, புரோட்டியோமிக்ஸ் அமைப்புகளின் சிக்கலான தன்மையின் காரணமாக அம்சத்தைக் கண்டறிதல் மற்றும் LC-MS சீரமைப்பு போன்ற பணிகளுக்கான கணக்கீட்டுத் திறனின் அதிகத் தேவையாகும். இந்த செயல்முறைகளுக்கு உதவுவதற்காக சமீபத்திய ஆண்டுகளில் பல மென்பொருள் கருவிகள் உருவாக்கப்பட்டுள்ளன, இருப்பினும் இந்தக் கருவிகள் மூலத் தரவிலிருந்து தகவல்களைச் சரியாகவும் முழுமையாகவும் பிரித்தெடுக்கின்றனவா என்பது பயனர்களுக்குத் தெளிவாகத் தெரியவில்லை. இந்தத் தாளில், LC-MS லேபிள் இல்லாத கணக்கீட்டு மென்பொருளின் செயல்திறனுக்கான வேகமான மற்றும் உலகளாவிய பார்வையை வழங்குவதற்கான விரிவான செயல்முறையை விவரித்தோம். கவனமாகக் கட்டுப்படுத்தப்பட்ட QC மாதிரிகள் மற்றும் ஸ்பைக்டின் புரதங்களைக் கொண்ட இரண்டு உயர்தர மாஸ் ஸ்பெக்ட்ரோமெட்ரி தரவுத்தொகுப்புகள் அத்தகைய மதிப்பீடுகளுக்கான தரநிலை தரவுத்தொகுப்புகளாகவும் வழங்கப்பட்டன.