ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

Coturnix coturnix japonica (ஜப்பனீஸ் காடை) இல் Retinol Binding Protein7 (RBP7) இன் சிலிகோ கட்டமைப்பு கணிப்பு, பகுப்பாய்வு மற்றும் ஆற்றல் கணக்கீடு

ஐஸ்வர்யா திவாரி, விஜய் லக்ஷ்மி சக்சேனா மற்றும் மிதுன் குமார் படேல்

உயிரியல் ரீதியாக மாறும் இயற்கையான ரெட்டினாய்டு (ரெட்டினோல் மற்றும் அதன் வளர்சிதை மாற்றங்கள், வைட்டமின் ஏ) கோடர்னிக்ஸ் ஜபோனிகா அல்லது ஜப்பனீஸ் காடைகளில் உள்ள புற-செல்லுலார், இன்ட்ராசெல்லுலர் மற்றும் நியூக்ளியர் புரதங்களால் இடைநிலைப்படுத்தப்படுகிறது. ரெட்டினாய்டுகள் முக்கியமாக பிளாஸ்மா ரெட்டினாய்டு பிணைப்பு புரதம் (RBP) மற்றும் எபிடிடைமல் ரெட்டினோயிக் அமிலம் பிணைப்பு புரதம் (ERABP) போன்ற இரண்டு ஊடகங்களால் கடத்தப்படுகின்றன, அதே நேரத்தில் செல்லுலார் ரெட்டினோல் பிணைப்பு புரதங்கள் (CRBPs) மற்றும் செல்லுலார் ரெட்டினோயிக் அமிலம் பிணைப்பு புரதங்கள் (CRABPs) செல்களுக்குள் ரெட்டினாய்டுகளை கொண்டு செல்கின்றன. . RBP7 இன் அமினோ அமிலங்களின் துல்லியமான விளக்கம், கட்டமைப்பின் கணிப்பு மற்றும் ஆற்றலைக் கணக்கிடும் போது கருத்தில் கொள்வது மிகவும் முக்கியம். பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ் கருவிகள் மற்றும் மென்பொருள் அணுகுமுறையைப் பயன்படுத்தி Coturnix japonica இல் RBP7 இன் கட்டமைப்பைக் கணிப்பதே ஆய்வின் நோக்கம். RBP7 புரதத்தில் உள்ள அமினோ அமிலங்களுக்கான φ, ψ மதிப்புகளின் ராமச்சந்திரன் சதி. இந்த கணக்கீட்டு அணுகுமுறையைப் பயன்படுத்தி Coturnix japonica இல் RBP7 இன் மொத்த ஆற்றல் 1047.341 KJ/mol ஆகும். மேலும் மொத்த குறைந்தபட்ச ஆற்றல் Cotunix japonica அல்லது japenese quail இல் 1026.898 KJ/mol ஆகும் . ஒவ்வொரு மூலக்கூறு, செயல்பாட்டுக் குழு மற்றும் அணு நிலைகளிலும் மீண்டும் மீண்டும் ஆற்றல் போக்குகள் காணப்படுகின்றன. ரெட்டினோல்களும் ரெட்டினோயிக் அமிலமும் கோடர்னிக்ஸ் ஜபோனிகாவில் மரபணு வெளிப்பாட்டின் மாறுபாடு மற்றும் கருவின் ஒட்டுமொத்த வளர்ச்சியில் அத்தியாவசியப் பாத்திரங்களை வகிக்கின்றன . இது கோடர்னிக்ஸ் ஜபோனிகாவில் (ஜப்பானிய காடை) கொழுப்பு திசுக்களின் வெளிப்பாட்டின் அடிப்படையில் RBP7 ஐ மிகவும் முக்கியத்துவம் வாய்ந்ததாக ஆக்குகிறது, ஏனெனில் RBP7 ஒரு புதிய கொழுப்பு-குறிப்பிட்ட மரபணுவாக செயல்படுகிறது.