மருத்துவ பரிசோதனைகளின் இதழ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

பான்-புற்றுநோயில் PTEN மரபணுவின் விரிவான உயிரியல் தகவல் பகுப்பாய்வு

ஹாங் ஜாங்†, வென்ஹான் சோ, சியாவோயி யாங், ஷுஜான் வென், பைச்செங் ஜாவோ, ஜியாலே ஃபெங், போஜோ சென், ஷுயிங் சென்*

பின்னணி: PTEN என்பது பலவகையான புற்றுநோய்களில் அதிக அதிர்வெண்ணில் மாற்றமடையும் மல்டிஃபங்க்ஸ்னல் கட்டி அடக்கி மரபணுவாகும். இருப்பினும், பான்-புற்றுநோய், தொடர்புள்ள மரபணுக்கள், உயிர்வாழும் முன்கணிப்பு மற்றும் ஒழுங்குமுறை பாதைகள் ஆகியவற்றில் அதன் வெளிப்பாடு முழுமையாக விவரிக்கப்படவில்லை. இங்கே, மருத்துவ பயன்பாட்டிற்கான குறிப்பை வழங்குவதற்காக, மேலே உள்ள கண்ணோட்டங்களில் இருந்து ஒரு விரிவான பகுப்பாய்வை நடத்துவதை நோக்கமாகக் கொண்டுள்ளோம். முறைகள்: TCGA மற்றும் GTEx தரவுத்தளத்திலிருந்து தரவைப் பயன்படுத்தி புற்றுநோய்களின் வெளிப்பாடு நிலைகளைப் படித்தோம். UALCAN தரவுத்தளத்திலிருந்து எக்ஸ்பிரஷன் பாக்ஸ் ப்ளாட்டைப் பெறவும், cBioportal இணையதளத்தில் பிறழ்வு பகுப்பாய்வு செய்யவும்,
GEPIA இணையதளத்தில் தொடர்பு மரபணுக்களைப் பெற்று, புரத நெட்வொர்க்கை உருவாக்கவும் மற்றும் STRING தரவுத்தளத்தில் KEGG மற்றும் GO செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வு செய்யவும் மற்றும் கப்லான்-மேயர் ப்ளாட்டர் இணையதளத்தில் முன்கணிப்பு பகுப்பாய்வு நடத்தவும். நாங்கள் ப்ரோமோ தரவுத்தளத்தில் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி கணிப்பு மற்றும் ஆர்என்ஏ-ஆர்என்ஏ அசோசியேஷன்/ஆர்என்ஏ-புரோட்டீன் இன்டராக்ஷனை ஆர்என்ஏஅப் வெப் சர்வர் மற்றும் ஆர்பிஎஸ்இக் ஆகியவற்றில் செய்தோம். மரபணு 3D அமைப்பு, புரத வரிசை மற்றும் பாதுகாக்கப்பட்ட டொமைன் ஆகியவை NCBI இலிருந்து பெறப்பட்டன.
முடிவுகள்: நாங்கள் படித்த அனைத்து புற்றுநோய்களிலும் PTEN குறைவாகவே வெளிப்படுத்தப்பட்டது. இது கட்டிகளின் மருத்துவ நிலையுடன் நெருக்கமாக தொடர்புடையது, புற்றுநோய் வளர்ச்சி மற்றும் முன்னேற்றத்தில் PTEN ஈடுபடலாம் என்று பரிந்துரைக்கிறது. PTEN இன் பிறழ்வுகள் பல்வேறு வகையான புற்றுநோய்களில் இருந்தன, அவற்றில் பெரும்பாலானவை துண்டிக்கப்பட்ட பிறழ்வுகள் மற்றும் தவறான பிறழ்வுகள். புற்றுநோய்களில் (KIRC, LUAD, THYM, UCEC, இரைப்பை புற்றுநோய், கல்லீரல் புற்றுநோய், நுரையீரல் புற்றுநோய், மார்பக புற்றுநோய்), PTEN இன் குறைந்த வெளிப்பாடு கொண்ட நோயாளிகளுக்கு குறுகிய OS நேரம் மற்றும் மோசமான OS முன்கணிப்பு இருந்தது. PTEN இன் குறைந்த வெளிப்பாடு சில புற்றுநோய்களில் (TGCT, UCEC, LIHC, LUAD, THCA) RFS இன் சிதைவை ஏற்படுத்தும், இது PTEN இன் வெளிப்பாடு மருத்துவ முன்கணிப்புடன் தொடர்புடையது என்று பரிந்துரைக்கிறது. எங்கள் ஆய்வு PTEN உடன் தொடர்புடைய மரபணுக்களைக் கண்டறிந்தது மற்றும் GEPIA இணையதளத்தில் இருந்து பெறப்பட்ட 100 PTEN தொடர்பான மரபணுக்களில் GO செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வு செய்தது. முடிவு: PTEN மரபணுவைப் புரிந்துகொள்வது மற்றும் அதனுடன் தொடர்புடைய ஒழுங்குமுறை பாதைகளின் ஆழமான ஆய்வு ஆகியவை கட்டி சார்ந்த உயிரியக்க குறிப்பான்கள் மற்றும் மருத்துவ சாத்தியமான சிகிச்சை இலக்குகளை கண்டுபிடிப்பதற்கான நுண்ணறிவை வழங்கக்கூடும்.