ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்
ஐ.எஸ்.எஸ்.என்: 0974-276X
ஐ.எஸ்.எஸ்.என்: 0974-276X
Tomo Yonezawa, Riho Kurata, Atsushi Tajima, Xiaofeng Cui, Hiroki Maruta, Hirofumi Nakaoka, Keiichi Nakajima மற்றும் Hidetoshi Inoko
நீண்ட சங்கிலி கொழுப்பு அமிலமானது உயிரணுக்களின் உயிரியல் செயல்பாட்டில் எண்ணற்ற பாத்திரங்களைக் கொண்டுள்ளது, இது ஒரு ஆற்றல் அடி மூலக்கூறு மட்டுமல்ல, உயிரணு சவ்வு தொகுப்புக்கான அடி மூலக்கூறுகளாகவும் மற்றும் உள்செல்லுலார் சிக்னலிங் மூலக்கூறுகளுக்கு முன்னோடியாகவும் உள்ளது. இருப்பினும், நீண்ட சங்கிலி கொழுப்பு அமிலத்தால் தூண்டப்படும் உயிரியல் பாதைகள் பற்றி அதிகம் அறியப்படவில்லை. நீண்ட சங்கிலி கொழுப்பு அமிலத்தின் பாதையை அடையாளம் காண, ஓலியேட்டுடன் அல்லது இல்லாமல் சிகிச்சையளிக்கப்பட்ட செல்களில் 2-பரிமாண ஜெல் எலக்ட்ரோபோரேசிஸைச் செய்தோம், பின்னர் PDQuest மென்பொருளைப் பயன்படுத்தி 648 புரதப் புள்ளிகளை பகுப்பாய்வு செய்து புள்ளிவிவர அளவுகோல் மூலம் 22 குறிப்பிடத்தக்க மாறும் புள்ளிகளைக் குறைத்தோம். MALDI-QIT-TOF-MS மற்றும் SWISSPROT தரவுத்தள வினவல் மூலம் இந்த இடங்களைக் கண்டறிய முயற்சித்தோம். நாங்கள் 11 புரதங்களைக் கண்டறிந்து, புரத-புரத தொடர்பு தரவுத்தளத்திலிருந்து கிடைக்கக்கூடிய தரவுத் தொகுப்புகளைப் பயன்படுத்தி உயிரியல் வலையமைப்பைக் கணித்தோம். இந்த கணிப்பு பல புரத கைனேஸ் Cs (PKCs) லாங்செயின் கொழுப்பு அமில சிக்னலின் கீழ் உள்ளது என்று சுட்டிக்காட்டியது. உண்மையில், ஓலேட் தூண்டப்பட்ட கணிக்கப்பட்ட PKC பாதைகள். எக்ஸ்பிரஷன் வரிசையில், ஓலியேட், டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் நிலைகளில், பிகேசி எப்சிலானை மட்டுமே கணிசமாகக் கட்டுப்படுத்துகிறது, ஆனால் மற்ற பிகேசிகள் அல்ல. ஒட்டுமொத்தமாக, எங்கள் புரோட்டியோமிக்ஸ் மற்றும் நெட்வொர்க் பகுப்பாய்வு நீண்ட சங்கிலி கொழுப்பு அமில சமிக்ஞையில் PKC எப்சிலான் பாதை முக்கிய பங்கு வகிக்கிறது என்பதைக் குறிக்கிறது.