ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்
ஐ.எஸ்.எஸ்.என்: 0974-276X
ஐ.எஸ்.எஸ்.என்: 0974-276X
நேஹா ஷர்மா, சத்ய வ்ரத் பரத்வாஜ், அஞ்சு ஷர்மா, மனிகா தோமர், ராஜிந்தர் கவுர், ப்ரீதம் தாஸ் தாக்கூர் மற்றும் அனில் ஹண்டா
வடமேற்கு இமயமலைப் பகுதிகளில் அமைந்துள்ள இமாச்சலப் பிரதேசத்தின் மலை மாநிலமான கோடைக்கால ஸ்குவாஷ் ( குக்குர்பிட்டா பெப்போ எல் .) செடிகளில், மொசைக், மஞ்சள், இலைகளின் ஷூ சரம், செடிகள் வளர்ச்சி குன்றியிருப்பது மற்றும் ஆரம்ப நிலையிலேயே தொற்று போன்ற அறிகுறிகளைக் காட்டும் வைரஸ் நோய் கண்டறியப்பட்டது. கோடைகால ஸ்குவாஷின் சந்தைப்படுத்தக்கூடிய பழங்களில் 94 சதவீதம் வரை பயிர் குறைப்பு ஏற்படலாம். தற்போதைய ஆய்வில் ELISA, RT-PCR மற்றும் Phylogeny ஆகியவற்றின் அடிப்படையில் காரணமான வைரஸ் கண்டறியப்பட்டு வகைப்படுத்தப்பட்டது. பகுதி சிபி மரபணு பெருக்கப்பட்டு வரிசைப்படுத்தப்பட்டது. பைலோஜெனடிக் ஆய்வுகளுக்காக 67 நியூக்ளியோடைடு மற்றும் பல்வேறு நாடுகளைச் சேர்ந்த ZYMV இன் 67 பாலிபுரோட்டீன் வரிசைகள் NCBI இலிருந்து பெறப்பட்டன. ஒவ்வொரு நாட்டின் நியூக்ளியோடைடு மற்றும் புரோட்டீன் வரிசைகளின் அடிப்படையிலான பைலோஜெனடிக் பகுப்பாய்வு, அதிகபட்ச சாத்தியக்கூறு (ML), அண்டை நாடு சேருதல் (NJ), அதிகபட்ச பார்சிமோனி (MP) மற்றும் கணக்கிடப்படாத ஜோடிக் குழு முறையின் எண்கணித சராசரி (UPGMA) முறைகளைப் பயன்படுத்தி ஃபிலிப் 3.68 மற்றும் HORIZOME, TM இது சோதனை வைரஸின் 91% ஒற்றுமையை வெளிப்படுத்தியது நியூக்ளியோடைடு வரிசை USA ZYMV CP வரிசையுடன் (D13914) மற்றும் ஜப்பானின் பகுதி பாலிபுரோட்டீன் வரிசையுடன் 75.9% ஒற்றுமை (BAE75935).