ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

ARDiTox: T-செல் ஏற்பிகளின் (TCRs) கணிப்புக்கான இயங்குதளம் சாத்தியமான ஆஃப்-இலக்கு பிணைப்பு

விக்டர் முர்சியா பியென்கோவ்ஸ்கி, தமரா போஷெர்ட், பியோட்டர் ஸ்கோசிலாஸ், அன்னா சனேக்கா-டுயின், மசீஜ் ஜாசின்ஸ்கி, பார்ட்லோமிஜ் க்ரோல்-ஜோசாகா, ஜியோவானி மஸ்ஸோக்கோ, ஸ்லாவோமிர் ஸ்டாச்சுரா, லூகாஸ் பன்ஸ், ஜான் காஸ்மார்சிக், எட்வர்டிஸ்.

செல்லுலார் இம்யூனோதெரபிகள், டி லிம்போசைட்டுகளை வெளிப்படுத்தும் நேட்டிவ் அல்லது இன்ஜினியரிங் செய்யப்பட்ட டி-செல் ரிசெப்டர்கள் (டிசிஆர்) போன்றவை ஏற்கனவே சிகிச்சை செயல்திறனை நிரூபித்துள்ளன. இருப்பினும், சில உயர்-இணைப்பு டிசிஆர்களும் ஆஃப்-டார்கெட் இம்யூனோடாக்சிசிட்டி காரணமாக ஆபத்தானவை என நிரூபிக்கப்பட்டுள்ளது. கட்டி செல்கள் மற்றும் ஆரோக்கியமான திசுக்களில் காணப்படும் எபிடோப்களுக்கு எதிராக நோயெதிர்ப்பு அமைப்பு செயல்படும்போது இந்த செயல்முறை நிகழ்கிறது. மேலும், சில டிசிஆர்கள் மிகவும் மாறுபட்ட காட்சிகளைக் கொண்ட எபிடோப்களுக்கு குறுக்கு-எதிர்வினையாக இருக்கும். இந்தச் சிக்கலைத் தீர்க்க, ARDitox, கணக்கீட்டு நோயெதிர்ப்பு மற்றும் செயற்கை நுண்ணறிவு (AI) அடிப்படையிலான சிலிகோ முறையில் ஒரு நாவலை உருவாக்கினோம் . சிலிகோவில் ARDitox இன் செயல்திறனை 4 வெவ்வேறு எபிடோப்களில் சோதித்தோம் , அங்கு TCRகள் புற்றுநோய் தொடர்பான ஆன்டிஜென்களை குறிவைக்க பயன்படுத்தப்பட்டன மற்றும் ஒரு வைரஸ் எபிடோப்பை இலக்காகக் கொண்ட TCR தொகுப்பில் உள்ளன. அவற்றில் இரண்டு குறிப்பிட்ட மருத்துவ விளைவுகளைக் கொண்டுள்ளன, இதில் நோயெதிர்ப்புத் தன்மை பதிவாகியுள்ளது (MAGEA3112-120 மற்றும் MAGEA3168-176 எபிடோப்கள்), ஒன்று எக்ஸ்-ஸ்கேன் அணுகுமுறையைப் பயன்படுத்தி சோதனை செய்யப்பட்டது (AFP158-166 எபிடோப்), மற்றும் கடைசியாக குறுக்கு-எதிர்வினை எபிடோப்கள் இல்லை. மருத்துவ பரிசோதனைகளில் கண்டறியப்பட்டது (NY-ESO-1157-165 epitope). ஒட்டுமொத்தமாக, ARDitox இலக்கியத்தில் கிடைக்கும் தரவுகளுக்கு ஏற்ப இம்யூனோடாக்ஸிக் எபிடோப்களை அடையாளம் கண்டுள்ளது. கூடுதலாக, NLGN4X மரபணுவால் குறியிடப்பட்ட பெப்டைடுக்கு எதிராக இன்னும் வளர்ச்சியில் இருக்கும் மிகவும் நம்பிக்கைக்குரிய TCR ஐ ஆராய்ந்தோம் . இந்த எபிடோப்பிற்கு, கிராஸ்-ரியாக்டிவ் பெப்டைடைக் கண்டறிந்தோம், இல்லையெனில் விட்ரோவில் கண்டறிவது கடினமாக இருக்கும் . முடிவில், சிலிகோ அணுகுமுறை என்பது ஒரு சக்திவாய்ந்த கருவியாகும், இது இலக்கு இல்லாத எபிடோப்களை துல்லியமாக அடையாளம் காணும் மற்றும் முன்கூட்டிய ஆய்வுகளில் கருத்தில் கொள்ளப்பட வேண்டும், ஏனெனில் இது பாதுகாப்பான புற்றுநோய் எதிர்ப்பு சிகிச்சையின் வளர்ச்சியை திறம்பட பூர்த்தி செய்யும்.