ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

மைஆர்என்ஏ மற்றும் அவற்றின் இலக்கு எஸ்என்பிகளை கண்டறிவதற்கான கணக்கீட்டு கருவிகளின் பயன்பாடு

ஜார்ஜ் பிரியா தாஸ். சி, டைக் ஐபி மற்றும் ராவ் சேதுமாதவன்

மைக்ரோஆர்என்ஏக்கள் (மைஆர்என்ஏக்கள்) சிறிய புரோட்டீன்-குறியீட்டு ஆர்என்ஏக்களின் ஒரு வகுப்பாகும், அவை பிளவு அல்லது மொழிபெயர்ப்பு ஒடுக்குமுறைக்கு இலக்காகி பல்வேறு உயிரியல் செயல்பாடுகளில் ஈடுபடுவதன் மூலம் முக்கியமான ஒழுங்குமுறை பாத்திரங்களை வகிக்கின்றன. பெரிய அளவிலான உயிரியல் தரவுகளின் குவிப்பு, மைஆர்என்ஏக்கள் கட்டியை ஒடுக்கிகளாகவும், புற்றுநோயாளிகளாகவும் செயல்பட முடியும் என்பதைக் குறிக்கிறது. பிறழ்வு, தவறான வெளிப்பாடு மற்றும் மாற்றப்பட்ட முதிர்ந்த மைஆர்என்ஏ செயலாக்கம் ஆகியவை புற்றுநோய் மற்றும் கட்டி வளர்ச்சியில் உட்படுத்தப்படுகின்றன. மைஆர்என்ஏக்களில் உள்ள பொதுவான ஒற்றை-நியூக்ளியோடைடு பாலிமார்பிஸங்கள் (எஸ்என்பி) மைஆர்என்ஏ வெளிப்பாடு மற்றும்/அல்லது முதிர்ச்சியை மாற்றுவதன் மூலம் அவற்றின் சொத்தை மாற்றலாம், இதனால் அவை ஆயிரக்கணக்கான இலக்கு எம்ஆர்என்ஏக்களில் தாக்கத்தை ஏற்படுத்தலாம், இதன் விளைவாக பல்வேறு செயல்பாட்டு விளைவுகள் ஏற்படலாம். இந்த வேலையில், பெருங்குடல் புற்றுநோய் மரபணுக்களில் மைஆர்என்ஏவால் குறிவைக்கப்பட்ட எம்ஆர்என்ஏக்களின் செயல்பாட்டுப் பங்கைக் கணிக்க கணக்கீட்டுக் கருவிகளைப் பயன்படுத்தினோம். PupaSuite, UTRscan மற்றும் miRBase ஐ மைஆர்என்ஏ மற்றும் அவற்றின் இலக்கைக் கணிக்க பைப்லைனாகப் பயன்படுத்த அனுமதிக்கும் ஒரு முறையை நாங்கள் வழங்கியுள்ளோம், மேலும் பெருங்குடல் புற்றுநோயில் எம்ஆர்என்ஏவின் செயல்பாட்டுப் பங்கை மதிப்பீடு செய்துள்ளோம்.