ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

மனித சீரம் உள்ள சவ்வு புரதங்களின் பகுப்பாய்வு

ஃபாம் டக் டான், டிரான் தாய் துவாங், ஃபாம் டின் மின், டோ டோன் லோய், நுயென் பிச் நி மற்றும் ஃபான் வான் சி

சீரம் மற்றும் சவ்வு புரதங்கள் புரோட்டியோமிக் பகுப்பாய்விற்கான இரண்டு மிகவும் கவர்ச்சிகரமான இலக்குகளாகும். முந்தைய சவ்வு புரத ஆய்வுகள் திசு மாதிரிகளில் கவனம் செலுத்த முனைகின்றன, அதே சமயம் சீரம் உள்ள சவ்வு புரதங்கள் மீதான ஆராய்ச்சி இன்னும் குறைவாகவே உள்ளது. இந்த ஆய்வில், மனித அல்புமின் மற்றும் IgG குறைக்கப்பட்ட செரா ஆகியவை SDS-PAGE மூலம் புரோட்டீமைப் பிரிப்பதற்காகப் பயன்படுத்தப்பட்டுள்ளன. கறை படிந்த பிறகு, புரோட்டீன் பின்னங்கள் கொண்ட ஜெல்கள் டிரிப்சின் மூலம் வெட்டப்பட்டு செரிக்கப்பட்டன. ஒவ்வொரு ஜெல் துண்டுகளிலிருந்தும் பிரித்தெடுக்கப்பட்ட பெப்டைட் கலவைகள் நானோ-லிக்விட் குரோமடோகிராபி-எலக்ட்ரோஸ்ப்ரே அயனியாக்கம் மாஸ் ஸ்பெக்ட்ரோமெட்ரி (NanoLCESI-MS/MS) மூலம் பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டன. புரதங்கள் Mascot v1.8 மென்பொருளால் அடையாளம் காணப்பட்டு MSQuant v1.5 மென்பொருளால் சரிபார்க்கப்பட்டது. இதன் விளைவாக, 1,216 சவ்வு புரதங்கள் உட்பட ஒரு தரவுத்தளமானது, அதில் 469 (38.6%) சவ்வு புரதங்கள் குறைந்தபட்சம் ஒரு டிரான்ஸ்மேம்பிரேன் டொமைன் (TMD) மூன்று வெவ்வேறு டிரான்ஸ்மேம்பிரேன் முன்கணிப்பு பயன்பாடுகளின் (Phobius, TMHMM, மற்றும் SOSUI) அடிப்படையில் அடையாளம் காணப்பட்டது. ஜீன் ஆன்டாலஜி படி அவற்றின் பங்கின் அடிப்படையில் இந்த புரதங்கள் மேலும் வகைப்படுத்தப்பட்டு, செல்லுலார் கூறு, மூலக்கூறு செயல்பாடு மற்றும் உயிரியல் செயல்முறை போன்ற பல்வேறு செயல்பாட்டு வகைகளாக வகைப்படுத்தப்பட்டன. சவ்வு புரோட்டியோமிக்ஸ் நோய்கள் தொடர்பான கூடுதல் பாதை ஆய்வை அனுமதிக்கும் மற்றும் மருந்து இலக்குகளை நன்கு புரிந்துகொள்ள உதவும் என்று எங்கள் முடிவுகள் தெரிவிக்கின்றன.