ஆன்டிவைரல்ஸ் & ஆன்டிரெட்ரோவைரல்ஸ் ஜர்னல்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

ஆஸ்திரேலியாவில் கன்கர்ரன்ஸ் D614G ஸ்பைக் புரோட்டீன் பிறழ்வு கொண்ட கொரோனா வைரஸ் Nsp2 RNA Topoisomerse I120F மரபுபிறழ்ந்தவர்களின் ஏராளமான பரிமாற்றம்

அசித் கே. சக்ரவர்த்தி

விப்ரியோ ஹீமோலிட்டிகா டிஎன்ஏ டோபோயிசோமரேஸ் ஐஏ/ஐவி மற்றும் டிஎன்ஏ பிரைமேஸ், டிஎன்ஏ கைரேஸ் மற்றும் பை-சப்யூனிட் டிரிபனோசோமா புரூசி டிஎன்ஏ டோபோயிசோமரேஸ் ஐபி ஆகியவற்றில் அமினோ அமில ஹோமோலஜி மூலம் என்எஸ்பி2 கொரோனா வைரஸ் புரதத்தை ஆர்என்ஏ டோபோயிசோமரேஸ் என முன்னரே கணித்தோம் . பல டிஎன்ஏ டோபோயிசோமரேஸ் I/III ஆர்என்ஏ டோபோயிசோமரேஸ் செயல்பாட்டைக் கொண்டுள்ளது மற்றும் இது போன்ற எங்கும் நிறைந்த என்சைம்கள் பாதுகாக்கப்பட்டு, பிரதியெடுத்தல் மற்றும் படியெடுத்தலை ஒழுங்குபடுத்துவதில் ஈடுபட்டுள்ளன. Nsp2 RNA topoisomerase பகுப்பாய்வு > 10000 orf 1a 4405 அமினோ அமில நீளம் கொரோனா வைரஸ் பாலிபுரோட்டின் பரஸ்பர சுயவிவரத்தை நாங்கள் இங்கே சோதித்தோம். 99.84% வரிசை ஒற்றுமை கொண்ட BLAST தேடலால் பிறழ்ந்த புரதங்கள் தேர்ந்தெடுக்கப்பட்டன மற்றும் 181- 818 aa பகுதி NsP2 புரதம் (புரத ஐடி. QIU82057) CLUSTAL ஒமேகா மென்பொருளைப் பயன்படுத்தி பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டது. 26 வெவ்வேறு பிறழ்வுகளை நாங்கள் கண்டறிந்தோம், அதில் பெரும்பாலான மாற்றங்கள் ஐசோலூசின் மற்றும் அலனைனில் வேலினாக அல்லது லியூசினாக ஃபெனிலனலினாக தேர்ந்தெடுக்கப்பட்டன, இது கொரோனா வைரஸ் ஆர்என்ஏ டோபோயிசோமரேஸின் பாதுகாக்கப்பட்ட தன்மையைக் குறிக்கிறது. I120F (Isoleucine to Phenylalanine) இல் பெரிய முட்டாள்தனமான மிக அதிகமான பிறழ்வுகள் காணப்பட்டன. மற்ற முக்கியமான பிறழ்வுகள் R27C, I198V, T85I, L410F, I559V மற்றும் P583S ஆகும். I120F பிறழ்வு ஆஸ்திரேலிய தனிமைப்படுத்தல்களில் ஏராளமாக இருந்தது மற்றும் அதன் பரவல் பங்களாதேஷ் மற்றும் அமெரிக்கா போன்ற பிற நாடுகளில் காணப்பட்டது. Nsp2 Topoisomerase இன் ஏராளமான I120F பிறழ்வு, திறமையான வைரஸ் பேக்கேஜிங்கிற்காக RNA கட்டமைப்பை உறுதிப்படுத்துவதன் மூலம் கொரோனா வைரஸின் பரவலை அதிகரிக்கக்கூடும் என்று நாங்கள் பரிந்துரைக்கிறோம். சுவாரஸ்யமாக, இத்தகைய பிறழ்வுகள் ஸ்பைக் புரதத்தின் D614G பிறழ்வுடன் இணைந்து கண்டறியப்பட்டது, இது> 70% தொற்றுநோயை அதிகரிக்கிறது. மாறாக, பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்ட அனைத்து P583S Nsp2 மரபுபிறழ்ந்தவர்களுக்கும் D614G ஸ்பைக் புரதம் பிறழ்வு இல்லை. பல அமைதியான பிறழ்வுகள் (5-7) மரபணு பரந்த பகுப்பாய்வு மூலம் கண்டறியப்பட்டன, ஆனால் N501Y ஸ்பைக் புரதம் பிறழ்வு இல்லை. இது Nsp2 புரதம் I120F பிறழ்வுடன் அதிக கொரோனா வைரஸ் பரவுவதற்கான இணைப்பைக் கணிக்கும் முதல் அறிக்கை மற்றும் புதிய வைரஸ் எதிர்ப்பு மருந்துகளைக் கண்டறிய இது முக்கியமானதாக இருக்கலாம்.