ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

டீப் ஆட்டோஎன்கோடர் கற்றலைப் பயன்படுத்தி ஒரு டெம்ப்ளேட் அடிப்படையிலான புரோட்டீன் கட்டமைப்பு மறுசீரமைப்பு முறை

ஹையோ லி, கியாங் லியு மற்றும் ஜியான்லின் செங்

புரோட்டீன் கட்டமைப்பு கணிப்பு என்பது கணக்கீட்டு உயிரியலில் ஒரு முக்கியமான பிரச்சனையாகும், மேலும் இது புரத செயல்பாடு ஆய்வு, புரத வடிவமைப்பு மற்றும் மருந்து வடிவமைப்பு போன்ற பல்வேறு உயிரியல் மருத்துவ பிரச்சனைகளுக்கு பரவலாக பயன்படுத்தப்படுகிறது. இந்த வேலையில், புரதக் கட்டமைப்பு புனரமைப்பிற்காக ஆழமாக அடுக்கப்பட்ட டெனோயிசிங் ஆட்டோஎன்கோடரை அடிப்படையாகக் கொண்ட ஒரு புதிய ஆழமான கற்றல் அணுகுமுறையை நாங்கள் உருவாக்கினோம். ஹோமோலோகஸ் டெம்ப்ளேட் புரதங்களின் 3D கட்டமைப்பு ஆயங்களை மட்டுமே உள்ளீடாகப் பயன்படுத்தி டெம்ப்ளேட் அடிப்படையிலான புரதக் கட்டமைப்பு முன்கணிப்புக்கு எங்கள் அணுகுமுறையைப் பயன்படுத்தினோம். PSI-BLAST தேடலின் மூலம் இலக்கு புரதத்திற்கான வார்ப்புருக்கள் அடையாளம் காணப்பட்டன. 3DRobot (பல்வேறு மற்றும் நன்கு நிரம்பிய புரத அமைப்பு சிதைவுகளை தானாகவே உருவாக்கும் ஒரு நிரல்) வார்ப்புருக்களிலிருந்து இலக்குக்கான ஆரம்ப டிகோய் மாதிரிகளை உருவாக்கப் பயன்படுத்தப்பட்டது. இலக்கு புரதத்திற்கான ஆழமான கற்றல் மாதிரியைப் பெற, அடுக்கப்பட்ட டெனோயிசிங் ஆட்டோஎன்கோடர் டிகோய்களில் பயிற்சியளிக்கப்பட்டது. பயிற்சி பெற்ற ஆழமான மாதிரியானது இலக்கு வரிசைக்கான இறுதி கட்டமைப்பு மாதிரியை மறுகட்டமைக்க பயன்படுத்தப்பட்டது. மிகவும் ஒத்த டெம்ப்ளேட் புரதங்களை வரையறைகளாகக் கொண்ட இலக்கு புரதங்களுடன், கணிக்கப்பட்ட கட்டமைப்புகளின் GDT-TS மதிப்பெண் 0.7 ஐ விட அதிகமாக உள்ளது, இது ஆழமான தன்னியக்க குறியீடானது புரத அமைப்பு புனரமைப்புக்கு ஒரு நம்பிக்கைக்குரிய முறையாகும் என்று பரிந்துரைக்கிறது.