ஜர்னல் ஆஃப் தியரிட்டிகல் & கம்ப்யூட்டேஷனல் சயின்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

புரோட்டீன் வரிசையின் மீது பி-காரணி அடிப்படையைக் கணிக்கும் ஆராய்ச்சி

Runyu Jing, Yuelong Wang, Yiming Wu, Yongpan Hua, Xu Dai1 மற்றும் Menglong Li

B-காரணி, Debye-Waller காரணி அல்லது வெப்பநிலை காரணி என்றும் அழைக்கப்படுகிறது, இது புரதத்தின் நெகிழ்வுத்தன்மையின் விளக்கமாகும், இது பொதுவாக PDB (புரோட்டீன் தரவு வங்கி) வடிவ கோப்புகளில் பயன்படுத்தப்படுகிறது. புரோட்டீன் படிகத்திலிருந்து ஒரு பி-காரணியை எக்ஸ்ரே சிதறல் மூலம் அளவிட முடியும், ஆனால் புரத வரிசையிலிருந்து நேரடியாகப் பெற முடியாது. எனவே, புரத வரிசையின் அடிப்படையில் மட்டுமே பி-காரணியை கணிப்பது தொடர்புடைய ஆராய்ச்சியாளர்களுக்கு சில குறிப்புகளை வழங்க முடியும். இந்த ஆய்வில், புரத வரிசையின் அடிப்படையில் பி-காரணியைக் கணிக்க முயற்சிக்கிறோம். அமினோ அமில எச்சங்களை விவரிக்க AAindex இல் உள்ள தகவல் மற்றும் கணிக்கப்பட்ட புரத இரண்டாம் நிலை அமைப்பு, உறவினர் அணுகல், கோளாறு மற்றும் ஆற்றல் மாற்றங்கள் ஆகியவை பயன்படுத்தப்படுகின்றன. மாடலிங் மற்றும் கணிப்புக்கு நான்கு இயந்திர கற்றல் முறைகள் பயன்படுத்தப்படுகின்றன. மாடலிங் செயல்திறனை மதிப்பிடுவதற்கு 5 மடங்கு குறுக்கு சரிபார்ப்பு பயன்படுத்தப்படுகிறது. இதன் விளைவாக, புரோட்டீன் வரிசையின் அடிப்படையில் பி-காரணியை கணிக்கவும் பகுப்பாய்வு செய்யவும் இந்த வேலை சில புதிய முறைகளை வழங்கியது, மேலும் இது தொடர்பான ஆராய்ச்சிகளுக்கு இந்த வேலை உதவியாக இருக்கும் என்று நம்புகிறோம்.