ஜர்னல் ஆஃப் புரோட்டியோமிக்ஸ் & பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

மக்காச்சோளத்தில் AAAP மரபணு குடும்பத்தின் ஒரு மரபணு-பரந்த பகுப்பாய்வு

லீ ஷெங், லின் டெங், ஹன்வீ யான், யாங் ஜாவோ, கிங் டோங், கியான் லி, சியாயு லி, பெய்ஜியு செங் மற்றும் ஹையாங் ஜியாங்

AAAP (அமினோ அமிலம்/ஆக்சின் பெர்மீஸ்) மரபணுக்கள் டிரான்ஸ்போர்ட்டர்களின் ஒரு பெரிய குடும்பத்தை குறியாக்கம் செய்கின்றன. AAAP குடும்பத்தின் ஒரு சில உறுப்பினர்கள் அரபிடோப்சிஸ் தலியானா மற்றும் அரிசி (Oryza sativa) ஆகியவற்றில் வகைப்படுத்தப்பட்டுள்ளனர். இருப்பினும், மக்காச்சோளத்தில் உள்ள AAAP மரபணுக்களைப் பற்றி அதிகம் அறியப்படவில்லை (Zea mays). எனவே, மக்காச்சோளத்தில் உள்ள அனைத்து AAAP மரபணுக்களையும் வகைப்படுத்த ஒரு முறையான உயிர் தகவலியல் பகுப்பாய்வை நாங்கள் செய்தோம், இதில் மரபணு வரிசை பகுப்பாய்வு, பாதுகாக்கப்பட்ட புரத களங்கள், குரோமோசோமால் இருப்பிடங்கள், பைலோஜெனடிக் உறவுகள், மரபணு பிரதிகள் மற்றும் மரபணு வெளிப்பாடு சுயவிவரங்கள் ஆகியவை அடங்கும். இந்த ஆய்வில், எழுபத்தொரு ZmAAAP மரபணுக்கள் அடையாளம் காணப்பட்டு ZmAAAP01 to ZmAAAP71 என பெயரிடப்பட்டது. மக்காச்சோளத்தில் உள்ள AAAP மரபணுக்களின் எண்ணிக்கை அரபிடோப்சிஸ் தலியானா (43) மற்றும் அரிசியில் (58) உள்ள எண்ணிக்கையை விட அதிகமாக உள்ளது. மக்காச்சோள மரபணுவில் AAAP மரபணு நகல்களின் அதிக சதவீதத்தை நாங்கள் கண்டறிந்தோம், இது AAAP மரபணு குடும்பத்தின் விரிவாக்கத்திற்கு பங்களித்தது. மேலும், மக்காச்சோளத்தில் AAAP மரபணு விரிவாக்கத்தில் பிரிவு நகல்கள் முக்கிய பங்கு வகித்தன. AAAP மரபணுக்கள் 10 மக்காச்சோள குரோமோசோம்களில் சமமாக விநியோகிக்கப்படுகின்றன, மேலும் அவற்றில் 31 பிரிவு குரோமோசோம்களில் 12 கிளஸ்டர்களுக்குள் விநியோகிக்கப்படுகின்றன. EST பகுப்பாய்வு மற்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் தரவு இரண்டும் பெரும்பாலான ZmAAAP மரபணுக்கள் ஏராளமான வெளிப்பாடு வடிவங்களை வெளிப்படுத்தியுள்ளன, இது மக்காச்சோளத்தில் AAAP மரபணு குடும்பத்தின் மாறுபட்ட மற்றும் புதுமையான செயல்பாடுகளை பரிந்துரைக்கிறது. இங்கு வழங்கப்பட்ட முடிவுகள் மக்காச்சோளத்தில் உள்ள AAAP மரபணு குடும்பத்தின் மேலும் செயல்பாட்டு பகுப்பாய்விற்கு பயனுள்ள தகவல்களை வழங்குகின்றன.