மரபணு பொறியியலில் முன்னேற்றங்கள்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

மரபியல் 2019: நன்னீர் பிரான்ஸ், மேக்ரோப்ராச்சியம் ரோசன்பெர்கியில் ஆய்வகத்திலிருந்து பண்ணை மேலாண்மை வரையிலான அளவு மரபணு மற்றும் சுற்றுச்சூழல் தொடர்புகள்

Tahereh Alinejad

இந்த ஆய்வில், நன்னீர் இறாலில் (மேக்ரோபிராச்சியம் ரோஸென்பெர்கி) உணரமுடியாத தர மூட்டுகளில் நீர் வெப்பநிலை மற்றும் சூழலியல் மாறுபாடுகளின் தாக்கம் பதினைந்து அடிப்படை எதிர்ப்பு குணங்களால் மதிப்பிடப்பட்டது. M.rosenbergii டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் தகவல் மற்றும் புரோட்டியோம் மீதான எங்கள் கடந்தகால விசாரணையின் மூலம் தரம் தேர்ந்தெடுக்கப்பட்டு திட்டமிடப்பட்டது. நன்னீர் இறால்களுக்கு வழங்கப்பட்ட பல்வேறு வெப்பநிலைகளின் தாக்கம் குறித்த ஆய்வக சோதனை நன்னீர் இறால் பண்ணையின் உள்நாட்டு வாழ்விடத்திற்கு பயன்படுத்தப்பட்டது. விதிமுறைப்படி இரண்டு தனித்துவமான பண்ணைகள் மற்றும் தரமற்ற நிர்வாகம் மற்றும் வன்பொருள் நடைமுறை ஆகியவை ஆய்வுக்காக தேர்ந்தெடுக்கப்பட்டன. 24 டிகிரி செல்சியஸ் முதல் 32 டிகிரி செல்சியஸ் வரையிலான பல்வேறு நீர் வெப்பநிலைகளில் நாளின் பல்வேறு நேர இடைவெளியில் சோதனைகள் வகைப்படுத்தப்பட்டன. சூடான ஸ்டன் மற்றும் பலகை கட்டமைப்புகளுக்கு எதிராக நன்னீர் இறால் அழிக்க முடியாத கட்டமைப்பின் தரமான காலநிலை இணைப்பு சீரம், ஹெபடோபேன்க்ரியாஸ் மற்றும் தசை ஆகிய மூன்று தனித்துவமான உறுப்புகளில் வேறுபட்ட தரமான உச்சரிப்பு விவரக்குறிப்பை (Fluidigm Biomark HD) பயன்படுத்துவதன் மூலம் குவிக்கப்பட்டது. நீரின் வெப்பநிலையை விரிவடையச் செய்வது நன்னீர் இறால் பாதிப்படையாத எதிர்விளைவுகளை நேரடியாக பாதிக்கிறது என்பதை முடிவு உறுதிப்படுத்தியது. அதேபோல், நன்னீர் இறால்களின் சீரம், ஹெபடோபான்க்ரியாஸ் மற்றும் தசை ஆகியவற்றில் உள்ள தரமான மூட்டுகளில் பல்வேறு நீர் வெப்பநிலையின் தாக்கம் வேறுபட்ட தர மூட்டு பரிசோதனை மூலம் கூடுதலாக ஆராயப்பட்டது. மூன்று கூட்டங்களின் தரமான உச்சரிப்புத் தகவலின் தொடர்பு, பாதிப்பில்லாத பாதைகளின் குறியீட்டு குணங்கள் அடிப்படையில் கீழ்-கட்டுப்பாடு மற்றும் வளர்சிதை மாற்ற குறியீட்டு குணங்கள் வெப்பநிலை அதிகரிப்புக்கு மாறாக மேலே நிர்வகிக்கப்படுகின்றன. எங்கள் விசாரணையில் லெக்டின் பாதையில் புதிய தரமான தொடர்பைக் கண்டறிந்தது, இது நன்னீர் இறால்களில் இயற்கையான அழுத்த குறிப்பான்களை மேம்படுத்துவதற்கான மற்றொரு சாத்தியமான போட்டித் தரமாக டச்சிலெக்டின் ஆகும். இந்த ஆய்வானது, இயற்கை அழுத்தத்தைத் தொடர்ந்து மான்ஸ்டர் புதிய நீர் இறால் பாதுகாப்பான பாதையின் வேறுபட்ட உச்சரிப்பு பற்றிய குறிப்பிடத்தக்க தரவை வழங்கியது, இது கடந்த கால தேர்வில் பெறப்பட்ட டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் தகவல்களிலிருந்து திட்டமிடப்பட்ட 15 குணங்களைப் பயன்படுத்தி இந்த இனத்தின் தரமான காலநிலை சங்கங்களின் புரிதலை மேம்படுத்த உதவுகிறது. தவிர, பண்ணை சூழலியல் ஆய்வு, அழுக்கு மற்றும் நீர் உள்ளடக்கம், இறால் தீவனம் மற்றும் வீட்டுத் தோட்டம் ஆகியவற்றின் தாக்கம் பற்றிய முக்கியத் தரவை நன்னீர் இறால் அழிக்க முடியாத தர மேம்பாடு மற்றும் பண்ணையில் விளைச்சல் குறித்த நிர்வாகிகளின் நுட்பங்களை அளித்தது.

சமீபத்தில், உயர்-செயல்திறன் கண்டுபிடிப்பு, எடுத்துக்காட்டாக, கட்டிங் எட்ஜ் சீக்வென்சிங் (NGS) எழுந்தது மற்றும் மரபணு மற்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக் ஆராய்ச்சி இரண்டிலும் பரவலாகப் பயன்படுத்தப்படுகிறது. NGS கண்டுபிடிப்புகள் வெவ்வேறு திசுக்கள் அல்லது சில நிபந்தனைகளில் வேறுபட்ட தரமான உச்சரிப்பை ஆய்வு செய்ய பயன்படுத்தப்படலாம், எடுத்துக்காட்டாக, மன அழுத்தம் மற்றும் நுண்ணுயிரிகளின் மாசுபாடு மற்றும் மாதிரி மற்றும் மாதிரி அல்லாத வாழ்க்கை வடிவங்களில். பெனாய்ட் இறால்களுக்கு டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக் ரீட்கள் உள்ளன, எடுத்துக்காட்டாக, பெனியஸ் மோனோடோன், லிட்டோபெனியஸ் வான்னாமி, ஃபென்னரோபீனியஸ் சினென்சிஸ், ஃபென்னரோபெனியஸ் மெர்குயென்சிஸ், மற்றும் மார்சுபெனேயஸ் ஜபோனிகஸ் ஆகியவை திசு-வெளிப்படையான வெளிப்பாடு, வைரஸ் நோய் போன்றவற்றை ஆராய்ச்சி செய்ய. மேலும், விப்ரியோ பாராஹேமோலிட்டிகஸ் மாசுபாடு, ஹெபடோபான்க்ரியாஸ் மற்றும் லிம்பாய்டு உறுப்பு ஆகியவற்றின் வெள்ளைப் புள்ளிக் கோளாறு தொற்று (WSSV) மற்றும் குடல் திசுக்கள் மற்றும் WSSV அல்லது PAMPV இன் வெளிச்சத்தில் குடல் திசு ஆகியவற்றின் காரணமாக எம்.ரோசன்பெர்கியின் ஹெபடோபான்க்ரியாஸின் முழு டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் வரிசைமுறையிலும் பல ஆய்வுகள் செய்யப்பட்டுள்ளன. நகல் (பாலி I:C). மிகவும் தாமதமாக, MrNV நோயின் வெளிச்சத்தில் எம். ரோசன்பெர்கி வளர்ந்த இறால்களின் ரத்தக்கசிவு திசுக்களின் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக் விசாரணை சிந்திக்கப்பட்டது. கணிசமான எண்ணிக்கையிலான வித்தியாசமான ஏராளமான பதிவுகள் வெவ்வேறு பாதுகாப்பான கருவிகளுடன் இடம் பெற்றன, எடுத்துக்காட்டாக, வடிவமைப்பு ஒப்புகை ஏற்பிகள், புற்றுநோய் தடுப்பு முகவர்கள் மற்றும் ஆண்டிமைக்ரோபியல் பெப்டைடுகள்

MrNV மாசுபாட்டுடன் தொடர்புடைய வித்தியாசமான பவுண்டரி பதிவுகளை வேறுபடுத்துவதற்கு, ஒவ்வொரு திடமான PL மற்றும் தற்காலிகமாக MrNV கறைபடிந்த PL இன் ஆறு மறுஉருவாக்கங்களில் RNA வரிசைமுறையை நாங்கள் செய்தோம். 5538 பதிவுகள் வித்தியாசமாகத் தொடர்புகொள்ளப்பட்டதாகவும், 2413 பதிவுகள் மேல்நோக்கி இயக்கப்பட்டதாகவும், 3125 பதிவுகள் கீழ்-கட்டுப்படுத்தப்பட்டதாகவும் முடிவுகள் நிரூபித்தன. அந்த பதிவுகளில், வைரஸ் நோய் காரணமாக இவற்றில் ஒரு பகுதி இயற்கையான பாதுகாப்பான கட்டமைப்பில் ஈடுபட்டுள்ளது.

எங்களுடைய சாதனையை அங்கீகரிக்க மற்றும் வேறுபட்ட செல்வத்தின் முடிவுகளை அங்கீகரிக்க, நாங்கள் qPCR உடன் ஒப்புதலுக்காக 9 ஃபோகஸ்களைத் தேர்ந்தெடுத்தோம், மேலும் இந்த குணங்களில் குறைந்த போலியான வெளிப்படுத்தல் விகிதத்தை வெளிப்படுத்தினோம். டிசைன் ஒப்புகை புரதங்கள் (PRPகள்) மற்றும் ஆன்டிவைரல் புரதம், ப்ரோபினோல் ஆக்சிடேஸ் (ProPO) கட்டமைப்பு, டோல்-IMD கொடியிடும் பாதைகள், நுண்ணுயிர் எதிர்ப்பு பெப்டைடுகள் (AMPs) மற்றும் இரத்தக் கொதிப்புச் சட்டகம் (AMPs) மற்றும் இரத்தம் போன்ற முக்கியத்துவக் கூட்டங்களால் சுட்டிக்காட்டப்பட்டபடி, DEG களின் தீர்வறிக்கையை நாங்கள் பிரித்தெடுத்தோம். அப்போப்டொசிஸ், புற்றுநோய் தடுப்பு முகவர் கட்டமைப்பு, மற்றும் RNA மின்மறுப்பு (RNAi). பல்வேறு ஆய்வுகள் RNAseq மற்றும் qPCR தகவல்களுக்கு இடையே உயர் உறவைக் காட்டியது. தவிர, பாக்டீரியா மற்றும் வைரஸ் மாசுபாட்டின் காரணமாக எம். ரோசன்பெர்கியின் RNAseq ஆய்வுகள் RNAseq மற்றும் qPCR முடிவுகளுக்கு இடையே உள்ள உயர் உறவை வெளிப்படுத்தின. எங்கள் உறுதியை மேம்படுத்த, இலவச ஆர்கானிக் எடுத்துக்காட்டுகளில் இந்த விளைவுகளை நாங்கள் அங்கீகரித்தோம். இரத்த தடித்தல் என்பது ஒரு நகைச்சுவை எதிர்வினையாகும், இது காயத்தின் போது ஹீமோலிம்ப் துரதிர்ஷ்டம் மற்றும் நுண்ணுயிர் பரவலை தடுக்கிறது. ஸ்காவேஞ்சரில், இரத்த உறைதல் என்பது ஹீமோசைட் மூலம் வழங்கப்படும் கால்சியம்-சபார்டினேட் டிரான்ஸ்க்ளூட்டமினேஸ் (TGase) மூலம் குறுக்கு-இணைக்கும் மொத்த தடித்தல் புரதங்களை (CPs) உள்ளடக்கியது. கடந்தகால ஆய்வுகள், M. ஜபோனிகஸில் உள்ள லைசோசைம் மற்றும் க்ரஸ்டின் மூட்டுவலி ஆகியவை TGase தீர்ந்துபோன இறாலில் குறைக்கப்பட்டு, இரத்தம் தடித்தல் கட்டமைப்பிற்கும் AMP களுக்கும் இடையே தொடர்பு இருப்பதாக பரிந்துரைத்தது. டிரான்ஸ்குளூட்டமினேஸ் மற்றும் ஹெமிசென்டின்-1 போன்ற ஐசோஃபார்ம் எக்ஸ்2 (எச்எம்சிஎன்1) மூட்டுவலி ஆகியவை கட்டுப்படுத்தப்பட்டதை நாங்கள் கண்டறிந்தோம். அதேபோல், RNAseq இல் 5.31-மடிப்பு மற்றும் qPCR ஆல் 16.07-ஓவர்லேப் மூலம் நிர்வகிக்கப்பட்ட HMCN1 இன் அறிக்கையை நாங்கள் அங்கீகரித்தோம். இந்த இரண்டு இரத்த உறைதல் பாகங்களும் MrNV இன் மாசுபாட்டின் எதிர்வினையாக சேர்க்கப்பட வேண்டும் என்று இந்த முடிவுகள் பரிந்துரைத்தன. தவிர, இரண்டு இரத்த உறைதல் பாகங்கள், லைசோசைம் மற்றும் க்ரஸ்டினின் சில ஐசோஃபார்ம்களின் உயர் வழிகாட்டுதல் ஆகியவை M. ரோசன்பெர்கியில் உள்ள இரத்த தடித்தல் கட்டமைப்பு மற்றும் AMP களுக்கு இடையேயான தொடர்பை நிரூபிக்கலாம்.