ஆன்டிவைரல்ஸ் & ஆன்டிரெட்ரோவைரல்ஸ் ஜர்னல்
திறந்த அணுகல்

சுருக்கம்

HIV-1 இன் V3 லூப்பில் பாதுகாக்கப்பட்ட GPGR பிரிவின் இணக்கத் தகவமைப்பை ஆய்வு செய்ய

சுதா ஸ்ரீவஸ்தவா மற்றும் மீனா கன்யால்கர்

ஒரு பயனுள்ள எச்.ஐ.வி தடுப்பூசியை வடிவமைக்க, gp120 இன் அதிவேகப் பகுதியான முதன்மை நடுநிலைப்படுத்தும் தீர்மானிப்பான் (PND) பெப்டைட்களின் வரிசை பன்முகத்தன்மை மற்றும் இணக்கங்களுக்கு இடையிலான உறவைப் படிப்பது முக்கியம். gp120 இன் 318-327 மற்றும் 315-329 ஆகிய இரண்டு துண்டுகள் PND ஆக மாற்றப்பட்டு, HIV-1 குறிப்பிட்ட சைட்டோடாக்ஸிக் லிம்போசைட் செயல்பாட்டைத் தூண்டலாம், அவை வைரஸால் பாதிக்கப்பட்ட செல்களைக் கொல்லக்கூடும். இதன் விளைவாக, gp120-V3 லூப்பில் இருந்து அதிக வரிசைப்படுத்தப்பட்ட மற்றும் உயிரியல் ரீதியாக தொடர்புடைய இம்யூனோஜெனிக் பகுதியின் வடிவமைப்பு, எச்.ஐ.வி-1 தடுப்பூசி வளர்ச்சிக்கு மிகவும் பயனுள்ள இம்யூனோஜென்களை வடிவமைப்பதில் உதவக்கூடும். உகந்த கட்டமைப்பு விருப்பங்களை அறிவூட்டுவதற்காக, முக்கியமாக கிரீடம் பகுதியை உள்ளடக்கிய GPGR வரிசையைக் கொண்ட gp120 இன் V3 லூப்பில் இருந்து இரண்டு துண்டுகளின் இணக்கத்தன்மையை நாங்கள் ஆராய்ந்தோம். அணு காந்த அதிர்வு (NMR) ஸ்பெக்ட்ரோஸ்கோபி மற்றும் மூலக்கூறு இயக்கவியல் (MD) உருவகப்படுத்துதல்கள் நீர் மற்றும் ஹெக்ஸாஃப்ளூரோஅசெட்டோன் (HFA) போன்ற பல்வேறு கரைப்பான் அமைப்புகளில் உள்ள இணக்கத்தை வரைபடமாக்க பயன்படுத்தப்படுகின்றன. HFA இல், பெரிய துண்டு, 315-329 இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்பை உருவாக்கும் நோக்கில் ஓரளவு சாய்வதைக் காட்டுகிறது. இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்பை அடைவதில் துண்டின் நீளம் முக்கியமானது என்பதை இது குறிக்கிறது, இது V3 லூப்பின் அதிவேக நிலைக்கு காரணமாக இருக்கலாம். இருப்பினும், தண்ணீரில், இரண்டு துண்டுகளும் குறிப்பிட்ட இணக்க விருப்பங்களைக் காட்டவில்லை.